上海治疗肝结核比较好的三甲医院有1、上海市第一妇婴保健院，2、上海市东方医院，3、上海市普陀区中心医院，4、复旦大学儿科医院枫林路门诊部，5、上海市公共卫生临床中心等，肝结核属于外科，上海市第一妇婴保健院外科疾病医疗设施齐全，在外科疾病治疗方面有着丰富的经验；上海市东方医院外科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名上海市第一妇婴保健院外科
上海市第一妇婴保健院东院于2013年8月建成并投入使用。设有产科、妇科、新生儿科、计划生育科、乳腺科、手术麻醉科、辅助生殖医学科、放射科、超声科、病理科、检验科、药剂科等临床和医技科室。医院拥有“上海市危重新生儿抢救中心”、“上海市产前诊断中心”。1983年起医院先后被任命为“WHO母婴保健科研和培训合作中心”和“WHO围产保健合作中心”。在围产保健、重危孕产妇的诊治、胎儿医学、不孕不育的诊治及新生儿窒息复苏等方面处于先进水平。
第二名上海市东方医院外科
上海市东方医院（同济大学附属东方医院）始建于1920年，是一所集医疗、教学、科研、急救、预防、康复、保健于一体的大型三级甲等综合性医院，医院现有国家临床重点专科1个（急诊医学）；上海市教委重点学科2个（临床医学、内科学心血管病）、高峰学科1个（干细胞与转化医学）、上海市卫生系统重中之重学科1个（重症医学）、上海市卫生系统重要薄弱学科1个（全科医学）、重点专科9个（心外、脑卒中、肿瘤、心衰、心梗、口腔、急创、骨科、中医）；浦东新区高峰学科3个（心血管病学、消化病学、急危重症学）、高原学科2个（肿瘤学、呼吸内科）。
第三名上海市普陀区中心医院外科
上海市普陀区中心医院（上海中医药大学附属普陀医院）始建于1957年，占地面积2.72万平方米，业务用房11万平方米，核定床位1000张，实际开放床位1300张，急诊床位160张，年出院3.5万人次，年手术2万例，年门急诊逾215万人次，是一所集医、教、研、防于一体的大型三级综合性医院，并且是上海中医药大学附属普陀医院、上海市第六人民医院联合共建医院、安徽医科大学临床医学院。
第四名复旦大学儿科医院枫林路门诊部外科
　　复旦大学附属儿科医院创建于1952年，由西门妇孺医院分院、中国红十字会第一医院儿科和中山医院儿科合并而成，原名上海第一医学院附属儿科医院，首任院长为国家儿科学一级教授陈翠贞。建院初期，以肇家浜路西门妇孺医院分院旧址为院址，1954年枫林路183号新医院启用。2000年4月原上海医科大学与复旦大学合并，更名为复旦大学附属儿科医院。医院设施优良，人才云集，是集医教研防为一体的综合性儿童专科医院，系...
第五名上海市公共卫生临床中心外科
上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心(简称“中心”)是复旦大学附属三级甲等医院;主要收治病毒性肝炎、妊娠肝炎、重症肝炎、肝硬化、伤寒、乙型脑炎、流行性出血热、流行性脑脊髓膜炎、化脓性及结核性脑膜炎、肠道传染病、艾滋病、破伤风、狂犬病、性病、肺结核、传染性非典型性肺炎等各种法定传染病。在重症肝炎、妊娠肝炎、中枢神经系统感染和艾滋病治疗等方面颇具特色,曾获多项临床成果奖和科研奖。中心现设有肝病科、感染科、妇产科、重症肝炎ICU科、特需科、中医科、呼吸科、外科、消化内科、麻醉科、儿科、五官科等临床科室和影像科、检验科等医技科室 [收起]