北京治疗甲亢比较好的三甲医院有1、北京协和医院，2、北京中医药大学东直门医院东区，3、北京市第一中西医结合医院，4、中国人民解放军火箭军总医院，5、北京复兴医院干部保健科 等，甲亢属于内分泌科，北京协和医院内分泌科疾病医疗设施齐全，在内分泌科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京中医药大学东直门医院东区内分泌科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京协和医院内分泌科
北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担高干保健和外宾医疗任务的医院之一，也是高等医学教育和住院医师规范化培训国家级示范基地，临床医学研究和技术创新的国家级核心基地。以学科齐全、技术力量雄厚、特色专科突出、多学科综合优势强大享誉海内外。在复旦大学医院管理研究所公布的“中国医院排行榜”中连续十年名列榜首。
第二名北京中医药大学东直门医院东区内分泌科
北京中医药大学东直门医院东区(原北京市通州区中医医院)坐落于北京的东大门, 始建于1982 年，目前拥有专业技术人员557人，高级职称60人，中级职称152人，研究生78人，博士生8人。科室齐全，设心病科、脑病科、康复科、内分泌科、脾胃病科、肺病科、外科、妇科、肛肠科、骨伤科等二十余个科室，拥有国家级重点专科3个，为脑病科、肺病科、心病科。针灸推拿科为北京特色专科，区级重点专科3个。
第三名北京市第一中西医结合医院内分泌科
北京市第一中西医结合医院，是一所由朝阳区政府主办的三级甲等中西医结合医院，集医疗、科研、教学、预防保健和急救为一体的公立医疗机构，设有心血管内科、内分泌科、骨伤科、脑病科、呼吸内科、外科、肾内科、眼科、儿科、妇产科等21个临床科室，11个病区，药剂科、检验科、放射科、病理科等9个医技科室，在原朝阳区体检中心基础上，积极发展中医预防保健工作，打造中西医结合特色突出的治未病科。
第四名中国人民解放军火箭军总医院内分泌科
医院位于北京市西城区新街口外大街16号，占地59亩，展开床位1100张，展开科室55个。拥有全军医学专科和专病中心5个（全军肝胆胃肠病专科中心、全军肛肠病专病中心，全军核辐射损伤医学监测与防治研究中心，全军脑卒中医疗救治研究中心、全军心理卫生指导中心），火箭军医学专科和专病中心10个；国家药物临床试验机构专业5个，博士后科研工作站1个。
第五名北京复兴医院干部保健科 内分泌科
　　首都医科大学附属复兴医院建于1950年，经过60多年的发展，现已成为集医疗、教学、科研、预防和社区卫生服务为一体的、拥有妇科内镜、心血管防治、危重症医学（ICU）、月坛社区服务等特色学科的三级综合医院。 　　医院建筑面积102133.71平方米，设有临床科室34个、医技科室9个，编制床位816张，开放床位798张。 　　全院有卫生技术人员1301人，其中高级技术人员184人，包括博士生导师3人... [收起]