广东广州治疗先天性心脏病比较好的三甲医院有1、南方医科大学珠江医院，2、广东省中医院，3、中山大学孙逸仙纪念医院，4、广东省人民医院，5、广州军区总医院等，先天性心脏病属于儿科，南方医科大学珠江医院儿科疾病医疗设施齐全，在儿科疾病治疗方面有着丰富的经验；广东省中医院儿科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名南方医科大学珠江医院儿科
珠江医院是南方医科大学（原第一军医大学）第二附属医院、第二临床医学院，创建于1947年，编设65个专业科室、35个教研室，拥有国家临床医学一级学科博士学位授权学科、博士后科研流动站，国家级、省级临床重点专科23个、国家重点培育学科1个、国家中医药管理局重点学科1个、国家级培训基地10个、广东省医疗质量控制中心2个。
第二名广东省中医院儿科
广东省中医院(广州中医药大学第二附属医院、广州中医药大学第二临床医学院)始建于1933年,是我国近代史上最早的中医医院之一,被誉为“南粤杏林第一家”。　广东省中医院形成了一百多个特色鲜明、疗效明显的专科专病,其中脑病专科、心血管病专科、皮肤病专科、肾病专科、乳腺病专科、妇科病专科、脊柱专科、中医急症、颈椎病(脊柱)专科、骨病骨肿瘤专科、骨关节病专科、消化病专科、呼吸病专科、肿瘤病专科、耳鼻喉病专科、中医外科、针灸科、糖尿病专科、肝病专科、冠心病专科等是国家级和省级的重点专科,在国内和省内处于领先地位。
第三名中山大学孙逸仙纪念医院儿科
中山大学孙逸仙纪念医院(中山大学附属第二医院)创建于1835年，是我国历史最为悠久的西医医院，至今已有177年的历史。伟大的革命先驱孙中山先生曾以“逸仙”之名在此学医并从事革命运动。百年传承，医院现已发展成为一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院。现有国家级临床重点专科6个，广东省临床重点专科11个，广东省“十二五”医学重点学科2个，广东省“十二五”医学重点实验室1个，广东省高校重点实验室1个。
第四名广东省人民医院儿科
广东省人民医院（广东省医学科学院）创建于1946年，下辖2个分院、6个门诊部和6个研究所，托管2家基层医院， 医院各专科亚专科设置齐全，共有12个国家临床重点专科、34个广东省临床医学重点专科/学科。我院2017年度全国最佳医院排行榜（复旦版）综合排名第29名，位居全国省级人民医院前列；排名进入全国前十的专科共5个：心外科（全国第3名）、心血管病（全国第4名）、老年医学（全国第6名）、急诊医学（全国第6名）、放射科（全国第9名）；专科提名获全国前十的有胸外科、风湿科、肿瘤学和康复医学。
第五名广州军区总医院儿科
广州军区总医院始建于1933年，是全国、全军首批三级甲等医院，医院设有60个专科，年门诊量125万人次。现拥有1个国家重点专病中心及2个博士后科研工作站；创建了创伤骨科中心、呼吸内科中心、临床麻醉中心、心血管病中心中心、激光整形中心、神经外科中心、下尿路疾病诊疗中心、辅助生育中心和临床护理培训中心9个全军医学专科(病)中心及全军临床药理基地、卫生信息技术基地；打造了12个军区医学研究所和专科中心、骨科被评为广东省重点专科，泌尿外科、心血管内科、中医科和药剂科被评为广东省特色专科。 [收起]