北京治疗先天性脊柱裂比较好的三甲医院有1、首都医科大学附属北京友谊医院，2、北京市平谷区中医医院，3、北京市回民医院，4、北京复兴医院干部保健科 ，5、中国人民解放军火箭军总医院等，先天性脊柱裂属于外科，首都医科大学附属北京友谊医院外科疾病医疗设施齐全，在外科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京市平谷区中医医院外科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名首都医科大学附属北京友谊医院外科
首都医科大学附属北京友谊医院原名为北京苏联红十字医院，始建于1952年。医院设有北京市临床医学研究所、北京热带医学研究所、北京市中西医结合研究所和北京市卫生局泌尿外科研究所，拥有一批学科带头人和技术骨干。胃肠肝胆胰疾病诊治、泌尿系统疾病诊治和肾移植、热带病和寄生虫病诊治以及中西医结合是医院的四大专业特色。内科学(消化系病)是国家重点(培育)学科;消化内科、临床护理、地方病(热带医学)、普通外科、重症医学科、老年病科、检验科、病理科获批国家临床重点专科。
第二名北京市平谷区中医医院外科
平谷区中医医院始建于1986年，是一所集中、西医医疗、康复、教学、科研为一体的综合性二级甲等中医医院，在医疗建设中，坚持以中医为主，中西医结合的方针，坚持突出中医特色和发挥中医药优势。以中药、针灸、推拿、康复训练、药治等中医传统疗法为主，结合现代医疗手段开展临床医疗。特别是在专科专病建设上，针灸科、康复科、推拿科、骨伤科、肛肠科等专科特色医疗，已被社会广泛认可。
第三名北京市回民医院外科
北京市回民医院始建于1947年，其前身是中国回教协会北京分会创办的“普慈施门诊部”。1949年更名为北京市回民医院，是一家具有民族特色的公立医院。医院历史上经过四次较大规模的改扩建,逐步发展为科室齐全的中西医结合（民族）医院。
第四名北京复兴医院干部保健科 外科
　　首都医科大学附属复兴医院建于1950年，经过60多年的发展，现已成为集医疗、教学、科研、预防和社区卫生服务为一体的、拥有妇科内镜、心血管防治、危重症医学（ICU）、月坛社区服务等特色学科的三级综合医院。 　　医院建筑面积102133.71平方米，设有临床科室34个、医技科室9个，编制床位816张，开放床位798张。 　　全院有卫生技术人员1301人，其中高级技术人员184人，包括博士生导师3人...
第五名中国人民解放军火箭军总医院外科
医院位于北京市西城区新街口外大街16号，占地59亩，展开床位1100张，展开科室55个。拥有全军医学专科和专病中心5个（全军肝胆胃肠病专科中心、全军肛肠病专病中心，全军核辐射损伤医学监测与防治研究中心，全军脑卒中医疗救治研究中心、全军心理卫生指导中心），火箭军医学专科和专病中心10个；国家药物临床试验机构专业5个，博士后科研工作站1个。 [收起]