安徽治疗菌血症比较好的三甲医院有1、安徽省立医院西区，2、安庆市立医院，3、蚌埠市第三人民医院，4、芜湖市中医医院，5、铜陵市人民医院等，菌血症属于血液科，安徽省立医院西区血液科疾病医疗设施齐全，在血液科疾病治疗方面有着丰富的经验；安庆市立医院血液科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名安徽省立医院西区血液科
安徽省肿瘤医院是安徽省唯一的集医疗、科研、教学、预防、康复于一体的公立三级甲等肿瘤专科医院。2003年在安徽康复医院基础上改建而成，已与安徽省立医院实行“人、财、物、信息、管理”五个统一，资源共享，集团化发展。故又名安徽省立医院西区。
第二名安庆市立医院血液科
安庆市立医院创建于1938年，现有临床科室33个、医技科室10个。拥有1个省优先发展重点专科（消化内科），1个省重点培育专科（神经内科），3个省重点特色专科（心胸外科、儿科、神经外科），8个市级医学重点专科（儿科、重症医学科、心胸外科、神经外科、麻醉科、消化内科、神经内科、妇产科），13个重点培育专科（临床药学、肿瘤外科、检验科、甲状腺乳腺外科、泌尿外科、肾内科、呼吸内科、口腔科、耳鼻咽喉科、心血管内科，肿瘤内科、内分泌科、血液内科），7个重点特色专科（护理学、小儿外科、超声影像科、感染性疾病科、病理科、眼科、老年病科）。
第三名蚌埠市第三人民医院血液科
蚌埠市第三人民医院成立于1953年11月3日，2004年经市政府批准增名“蚌埠市中心医院”，1996年被国家原卫生部授予三级甲等医院，是安徽省首批集医、教、研、防为一体的地市级三甲医院。2018年门急诊量105.6万人次，出院病人4.1万人次，完成住院手术1.5万台次，其中三、四类手术占比为66.3％。
第四名芜湖市中医医院血液科
安徽中医药高专附院芜湖市中医医院始建于1958年，建院至今有50年。是安徽省创办最早的中医院之一。医院拥有门诊综合楼、住院病房楼、急诊楼、制剂楼和行政楼等一批建筑群，业务用房面积近20000平方米，开设病床400张，设有20个主要临床科室、67个具有中医特色的专病门诊、15个医技科室。在编职工有515人，其中卫技人员427人，高级职称和知名专家70人，中级职称145名。人才济济,专家云集,各科专业技术人员形成梯队，技术力量雄厚。
第五名铜陵市人民医院血液科
铜陵市人民医院是皖中南地区一所新型的集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的现代化综合性三级甲等医院。医院现为国家级爱婴医院、皖南医学院非直属附属医院、安徽医科大学临床学院、南京医科大学研究生课程进修班联合办学单位、上海第一人民医院医疗集团理事单位、意大利锡耶纳大学医院协作医院、国家级住院医师规范化培训基地、国家卫生计生委脑卒中筛查与防治基地、上海交通大学医学院附属瑞金医院合作单位，同时也是铜陵地区唯一的涉外医院和国际紧急救援中心网络医院，连续三届被授予“全国文明单位”，2011年被原省卫生厅列入地市级区域医疗中心。 [收起]