全国治疗小儿偏头痛比较好的三甲医院有1、广东省第二中医院，2、广州医科大学附属第二医院，3、广东省中西医结合医院，4、天津市儿童医院，5、天津市第二人民医院等，小儿偏头痛属于中医科，广东省第二中医院中医科疾病医疗设施齐全，在中医科疾病治疗方面有着丰富的经验；广州医科大学附属第二医院中医科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名广东省第二中医院中医科
广东省第二中医院（广东省工程技术研究院）始建于1993年，是广东省卫生厅和省中医药局直属的综合性省级中医医疗机构，是广州市急救医疗网络（120）单位、医保定点三级甲等医院、广东省高等医学院校教学医院、广州中医药大学附属医院、香港大学实习医院、国家药物临床试验机构、广东建设中医药强省中医名院建设单位。医院注重发挥中医药特色优势，传承中医药理论和方法，形成了特色鲜明、疗效显著的专病专科30多个。其中中医心病学、针灸康复学及中医药工程技术学已被评为国家级重点学科。心血管科、脑病科、骨伤科、肿瘤科、护理及临床药学等7个专科被评为国家级重点专科。脾胃病、呼吸、内分泌、妇科、外科等为省级重点专科（专病）。
第二名广州医科大学附属第二医院中医科
广州医科大学附属第二医院（简称广医二院）于1982年12月正式挂牌，现有编制床位1331张。医院环境优美，学科齐全、技术力量雄厚、专科特色突出。内科学、神经病学为广东省重点学科；外科学、妇产科学、儿科学、临床检验诊断学为广东省重点扶持学科；神经病学为广东省卫生厅重点学科。心血管内科、神经外科、重症医学科、神经内科、急诊科、普通外科、康复科、医学检验科先后被评为广东省临床重点专科，2013年，医院新增胸外科、肾内科、医学影像科、眼科、内分泌科和呼吸内科等6个广东省临床重点专科，疼痛科、过敏反应科被评为国家临床重点专科。
第三名广东省中西医结合医院中医科
广东省中西医结合医院创建于1993年，是一家集临床、教学、科研、健康、保健、康复科学于一体的三级甲等中西医结合医院，设有急诊、ICU、内科、外科、骨科、妇科、儿科、康复科、麻醉手术科、肿瘤科、口腔科、皮肤科等一级临床科室13个，心血管、肾内、内分泌、神经内、呼吸、消化、感染、普外、神经外、肛肠、泌外、耳鼻喉、眼科、手足外等二级临床科室13个，开设专科专病47种。年门诊量达130多万人次，出院病人2.2万人次。
第四名天津市儿童医院中医科
天津市儿童医院（天津大学儿童医院）是天津市唯一一家三级甲等综合性儿科医院，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、健康管理为一体。是天津医科大学、南开大学医学院儿科临床学院。医院包括马场和龙岩两个院区1721床，人员、技术、设备共享，一体化运行，服务辐射整个华北地区。马场院区占地5.5万平方米，开放床位521张。龙岩院区占地8.3万平方米，开放床位1200张。
第五名天津市第二人民医院中医科
天津市第二人民医院始建于1920年，现已发展为一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体，内、外、妇、儿全面发展，以肝病综合治疗为特色的三级甲等专科医院。 　　医院在肝癌、肝硬化诊疗方面拥有国际最先进的多学科协作团队。所有肝癌患者均经肝内科、介入科、超声消融科、肝外科、病理科等专家联合会诊，获得最合理的个体化综合治疗方案，进而达到最佳疗效，改善预后明显。医院诊治的病毒性肝炎患者人数在全国名列前茅，是天津及华北地区肝病诊疗的权威单位之一。 　　医院的传染病学科被确定为天津市临床优势学科、天津市优势领域学科、天津市重点发展学科。在 [收起]