湖南治疗小儿偏头痛比较好的三甲医院有1、长沙市中医院，2、长沙市妇幼保健院，3、湘潭市妇幼保健院，4、怀化市第三人民医院，5、湘西民族中医院等，小儿偏头痛属于中医科，长沙市中医院中医科疾病医疗设施齐全，在中医科疾病治疗方面有着丰富的经验；长沙市妇幼保健院中医科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名长沙市中医院中医科
长沙市中医医院（长沙市第八医院）有着悠久的历史和深厚的文化底蕴。2006年9月，星沙新院建成开业。2007年初，在政府主导下，始建于1958年的原长沙市中医医院与始建于1959年的原长沙市第七医院成功合并，集中西医之所长，历经半个多世纪的风雨历程，已发展成为集医疗、急救、保健、科研、教学于一体的三级甲等综合型中医医院。总占地面积达180余亩，开放床位1767张，实行“一院三址”的运行模式，分为本部、南院、东院三个院址：本部设在星沙，主要承担长沙市东部和长沙县区域范围的医疗急救任务；南院（长沙市骨伤科医院）为原长沙市中医医院，地处繁华的南门口；东院为原长沙市第七医院，位于火车站附近。
第二名长沙市妇幼保健院中医科
我院始建于1962年，1987年由所改院，地址位于长沙市雨花区城南东路416号，长沙市卫生健康委直属副县级全民事业单位，目前占地面积1.53万平方米，建筑面积4.01万平方米，编制床位600张，在岗人员1097人，是一所集预防、保健、医疗、康复、科研和教学为一体三级甲等妇幼保健院，作为长沙市妇幼保健计划生育服务中心，肩负着全市三县（市）六区妇幼卫生和计划生育工作的业务管理与指导任务。
第三名湘潭市妇幼保健院中医科
湘潭市妇幼保健院（湘潭市妇女儿童医院、湘潭市妇幼保健计划生育服务中心）始建于1953年，是一所集保健、医疗、科研、教学于一体的三级甲等妇幼保健机构，是“湘潭市妇幼保健院医疗健康集团”核心机构，全市的产前诊断中心、新生儿疾病筛查中心、危重孕产妇救治中心、新生儿急救中心、出生缺陷综合防治中心，也是湘潭市首批爱婴医院，全市唯一一所妇女儿童医院。目前，湘潭市妇幼保健院一院两址（河东本部院区和河西院区）。总占地面积43亩，业务用房6万平方米，在职职工794人，其中高级专业技术人员148人；编制床位400张，可开放床位800张；年分娩量占城区的60％以上。
第四名怀化市第三人民医院中医科
医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健于一体的国家三级甲等综合医院,占地面积270亩，设临床医技科室46个，编制病床1200张。在职职工1200余人，高级职称近200人，博、硕士96人。设临床教研室17个，是住院医师规培基地协同医院，全科医生培训基地；是湖南胸痛中心、创伤中心、卒中联盟单位，怀化市危重孕产妇救治中心，侗医药研究湖南省重点实验室，中国肺癌防治联盟肺结节诊治分中心，湖南省个体化给药咨询指导怀化分中心，国家Ⅰ期药物临床试验中心、中国创伤联盟怀化市区域创伤救治中心,湖南省呼吸与危重症疾病临床医疗技术示范基地，湖南省多发重症创伤救治临床医疗技术示范基地。
第五名湘西民族中医院中医科
湘西土家族苗族自治州民族中医院是湘西州第一所集医疗、教学、科研、康复于一体的现代化三级甲等中医医院和爱婴医院，是国家地市级重点中医医院和国家重点民族医医院，是湖南中医药大学第二附属医院技术对口协作医院，是吉首大学附属中医院，是国家第一批中医全科医师培训基地，是大湘西地区唯一的中医住院医师规范化培训基地，是湖南中医药大学博士生、研究生培训、实习基地。 [收起]