1.昆明市中医院中医科

昆明市中医医院始建于1956年，是一所集医疗、教学、科研、防保、康复、社区医疗等综合服务能力为一体的“三级甲等中医医院”、云南中医学院第三附属医院、云南省中医名院、云南陆军预备役师医院、国家中医药管理局中医药优势学科（中医外科肛肠病学）继续教育基地、国家中医药管理局社区中医药知识与技能培训示范基地，国家中医药管理局农村中医药知识与技能培训示范基地，云南省中医药全科医师培训基地，云南省中医住院医师规范化培训基地，云南省中医药骨干医师培训基地，昆明市中医药制剂中心。曾荣获“全国卫生系统先进集体”、“云南省中医药工作先进集体”称号。

2.昆明医科大学第二附属医院中医科

昆明医科大学第二附属医院（昆医大附二院）建院于1952年10月，原名为昆明市工人医院。医院科室齐全，学科优势突出，设有肝胆胰外科、泌尿、康复医学、烧伤、重症医学、骨科、微创、护理、消化、血液、神经内科等学科，医院现有62个临床和医技科室，2个国家临床重点专科建设项目，16个省级临床重点专科建设项目。

3.昭通市中医医院中医科

云南省昭通市中医医院始建于1981年，经过35年的艰苦奋斗，现已成为一所集医疗、科研、教学、预防、保健、康复、文化、产业于一体的国家级三级甲等中医医院，能为患者提供一流的全科医疗服务。医院始终坚持“以病人为中心”的服务理念，秉承“进德修业，大医精诚”的院训，不断完善中医药管理体系，不断加强内涵建设、能力建设，不断提高医疗技术水平，以实现“实力中医院、和谐中医院、魅力中医院、生态中医院”的总体目标。

4.玉溪市人民医院中医科

云南省玉溪市人民医院·昆明医科大学第六附属医院位于滇中腹地玉溪市的市中心。始建于1950年，历经69载，逐渐发展成为集医疗、教学、科研、急救、预防、保健、康复为一体的三级甲等综合医院。医院工作用房占地面积71.78亩，建筑面积7.68万平方米（不含在建9.38万平方米改扩建大楼），总资产10.5亿元，编制病床1500张，实际开放床位1500余张。2019年1月1日儿童医院剥离后，医院现有在岗职工1946人。

5.文山州中医医院中医科

文山州中医医院成立于1985年9月1日，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的三级甲等中医医院，设有痿病科(重症肌无力专科)、内科、骨伤科、外科、心脑科、肛肠科、针推科、麻醉科、康复科、妇产科、耳鼻喉科、口腔科、精神科、急诊科、检验科、医学影像科、功能科、药剂科、制剂科、艾滋病门诊等科室。