全国治疗生殖器疱疹比较好的三甲医院有1、首都医科大学附属北京妇产医院，2、首都医科大学附属北京同仁医院，3、上海市皮肤病医院，4、河南中医药大学第一附属医院，5、沈阳市第七人民医院等，生殖器疱疹属于性病科，首都医科大学附属北京妇产医院性病科疾病医疗设施齐全，在性病科疾病治疗方面有着丰富的经验；首都医科大学附属北京同仁医院性病科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名首都医科大学附属北京妇产医院性病科
首都医科大学附属北京妇产医院 北京妇幼保健院是集医疗、教学、科研、预防、保健为一体，以诊治妇产科常见病、多发病和疑难病症为重点的国内知名的三级甲等妇产专科医院。目前医院已从建院当年的产科、妇科两个临床科室，发展为有围产医学部、新生儿科、妇科、妇科微创中心、妇科肿瘤科、计划生育科、生殖医学科、内分泌科、中医科、放射科、超声科、检验科、围产保健管理科、新生儿疾病筛查管理科、妇女保健科等30多个医疗、医技、保健科室的三级甲等妇产专科医院。
第二名首都医科大学附属北京同仁医院性病科
首都医科大学附属北京同仁医院始建于1886年，是一所以眼科学、耳鼻咽喉科学为国家重点学科的大型综合三甲医院。今天的医院分为崇文门院区和亦庄院区，现有职工3600余人。医院设有64个临床和医技科室，编制床位1759张，2019年年门急诊量290.2万人次，出院人数10.9万人次，手术人数8.1万人次。
第三名上海市皮肤病医院性病科
上海市皮肤病医院始建于1945年，是目前全市唯一一所以皮肤病、性病、神经内科为诊疗特色的三级专科医院，荣获上海市文明单位、上海市平安单位、上海市卫生系统职业道德基地称号。医院占地面积61.89亩，包括保德路、武夷路和虬江路，核定床位260张。现有职工324人，其中具有高级技术职称者25人，硕士研究生及以上学历者76人。 多年来，医院承担同济大学医学院、扬州大学医学院、安徽医科大学、安徽理工大学本科生、硕士研究生、博士研究生的培养任务，是上海市住院医师规范化培养基地。
第四名河南中医药大学第一附属医院性病科
河南中医学院第一附属医院医院始建于1953年，前身为河南省人民政府军政机关中医诊所；后与开封市第一中西联合医院合并成立河南省中医院；1956年随河南省政府机关迁入郑州市现院址；1959年归属河南中医学院，更名为河南中医学院附属医院，1988年正式启用"河南中医学院第一附属医院"院名，是一所综合性中医医院。
第五名沈阳市第七人民医院性病科
沈阳市第七人民医院暨沈阳市中西医结合医院、沈阳市皮肤病医院。始建于1942年，是一所以中西医结合为特色，以皮肤科为重点，集医、教、研功能于一体的市属综合性医院。1999年被评为辽宁省中西医结合示范医院及中西医结合十佳医院，2006年被评为中西医结合三甲医院，2012年皮肤科获国家临床重点专科。医院总院位于沈阳市中心城区-和平区，总占地面积12362平方米，总建筑面积43883.63平方米，其中医疗用房面积40608平方米。 [收起]