全国治疗毛囊炎比较好的三甲医院有1、四川大学华西医院，2、复旦大学附属华山医院，3、北京大学第三医院，4、解放军第306医院，5、北京中医药大学第三附属医院等，毛囊炎属于皮肤科，四川大学华西医院皮肤科疾病医疗设施齐全，在皮肤科疾病治疗方面有着丰富的经验；复旦大学附属华山医院皮肤科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名四川大学华西医院皮肤科
现有教育部国家重点学科9个，重点培育学科2个；有国家卫生计生委国家临床重点专科32个，数量名列全国医院第一；在复旦大学中国最佳专科声誉和最佳医院排行榜上，连续九年名列全国第二。领军人才方面：有两院院士2人、973首席科学家3人、长江学者12人、国家杰出青年科学基金获得者14人、省级学术技术带头人121人；31人担任国家级学会/协会主委、副主委，259人担任省级学会/协会主委、副主委。
第二名复旦大学附属华山医院皮肤科
复旦大学附属华山医院创建于1907年，是复旦大学附属综合性教学医院和中国红十字会直属医院，1992年首批通过国家三级甲等医院评审，全院共设39个临床医技科室，尤以神经内外科、皮肤科、手外科、中西医结合、传染病科、脊柱和关节外科、肾脏病科、泌尿外科、肾移植、胰腺外科、乳房外科、内分泌科、职业病和风湿科、颌面外科、影像医学和核医学、运动医学、康复医学为特长，其中神经外科、手外科、中西医结合科、泌尿外科、神经内科、传染病学和抗生素、肾病科、心血管科、影像医学和核医学、普外科为国家级重点学科，临床神经医学、手外科为上海市领先学科，神经外科、手外科被命名为上海市临床医学中心。
第三名北京大学第三医院皮肤科
北京大学第三医院建于1958年，国家卫生健康委委管医院，集医疗、教学、科研、预防、康复与保健为一体的综合性三甲医院。2018年底，在岗职工5157人，开放床位1891张。医院有36个临床科室、10个医技科室。有27个博士点、1个临床博士后流动站。在岗博士生导师57人，中国科学院院士1人、中国工程院院士2人，国家千人计划1人，国家自然科学基金杰出青年基金获得者3人、科技部“973”首席科学家1人、教育部“长江学者特聘教授”2人，2人入选国家级“新世纪百千万人才工程”，青年千人计划1人，国家自然科学基金优秀青年科学基金获得者4人，卫生部突出贡献专家10人。
第四名解放军第306医院皮肤科
特色医学中心（原解放军第306医院）是一所技术人才密集、临床学科齐全、仪器设备先进、整体医疗水平较高的现代化综合性三级甲等医院，展开床位1008张，编设42个科室，是北京市首批“基本医疗保险定点医院”、国家航天发射卫勤保障的定点医院。中心拥有一批技术雄厚的医学专科中心：全军脊柱外科中心、全军口腔疾病诊治中心、全军糖尿病诊治中心、全军信息与技术支持基地和总装心血管中心、普通外科中心、特种病诊治中心、医学影像中心，形成了以全军专科中心为重点的优势学科群。
第五名北京中医药大学第三附属医院皮肤科
北京中医药大学第三附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的三级甲等中西医结合医院。是国家中医药管理局重点中西医结合医院建设单位、教育部直属医院、北京中医药大学第三临床医学院。医院编制床位520张，有30个临床科室，5个医技科室， 4个门诊部，3个社区卫生服务站;医院有正高职称专家41名，副高职称专家72名，具有博士学位人员72名，硕士学位人员114名，医院有北京中医药大学经方现代临床应用研究所、北京中医药大学骨伤科研究所。 [收起]