上海治疗细菌性肺炎比较好的三甲医院有1、复旦大学附属中山医院，2、上海中医药大学附属龙华医院，3、上海市胸科医院，4、上海市普陀区中心医院，5、复旦大学儿科医院枫林路门诊部等，细菌性肺炎属于外科，复旦大学附属中山医院外科疾病医疗设施齐全，在外科疾病治疗方面有着丰富的经验；上海中医药大学附属龙华医院外科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名复旦大学附属中山医院外科
复旦大学附属中山医院是国家卫生和计划生育委员会预算管理单位，是复旦大学的附属综合性教学医院。医院开业于1937年，是当时中国人管理的第一所大型综合性医院，隶属于国立上海医学院，医院设有除儿科以外的所有科室、综合实力雄厚。心脏、肝癌、肾脏和肺部疾病诊治是医院的重点和特色，诊治水平始终处于国内领先地位。国家临床重点专科18个：消化科、检验科、麻醉科、心血管内科、内分泌科、胸外科、心脏大血管外科、临床护理、中医脑病科、呼吸内科、肾病科、普通外科、重症医学科、肿瘤科、医学影像科、器官移植科、急诊医学科和神经内科。心血管病和肝肿瘤为上海市临床医学中心。
第二名上海中医药大学附属龙华医院外科
龙华医院创建于1960年7月,是全国最早建立的四大中医临床基地之一。有4个国家级重点学科、7个国家中医药管理局重点专科（专病）、5个国家中医药管理局三级实验室、1个国家中医药管理局重点研究室、2个上海市临床医学中心、5个上海市优势专科、9个上海市中医特色专科。中医特色鲜明,中医药在治疗恶性肿瘤、骨退行性病变、肾病、胆石病、风湿病、眼病、乳腺病、肛肠病、脾胃病、呼吸病、疮疡病等有显著的疗效；同时医院有冬令进补膏方门诊、冬病夏治门诊、中医特色体检门诊等,每年都吸引了大批患者前来就诊。
第三名上海市胸科医院外科
上海市胸科医院创建于1957年，为我国最早建立的集医疗、教学、科研为一体的，以诊治心、肺、食管、气管、纵隔疾病为主的三级甲等专科医院。设有10个临床科室和10个医技科室，医院开展的单肺、双肺、肺叶移植术，冠心搭桥术，心脏单、双瓣膜置换术及瓣膜成形术，各种心脏复杂畸形的诊治，各类肺、食管、气管、纵隔手术，心胸外科微创手术、包括达芬奇机器人手术系统辅助下的心胸手术，各类心脏疾病的介入诊治，恶性心律失常和急性心肌梗塞的救治，气管镜的诊疗技术以及病理细胞、组织学检测等均居国内先进水平。
第四名上海市普陀区中心医院外科
上海市普陀区中心医院（上海中医药大学附属普陀医院）始建于1957年，占地面积2.72万平方米，业务用房11万平方米，核定床位1000张，实际开放床位1300张，急诊床位160张，年出院3.5万人次，年手术2万例，年门急诊逾215万人次，是一所集医、教、研、防于一体的大型三级综合性医院，并且是上海中医药大学附属普陀医院、上海市第六人民医院联合共建医院、安徽医科大学临床医学院。
第五名复旦大学儿科医院枫林路门诊部外科
　　复旦大学附属儿科医院创建于1952年，由西门妇孺医院分院、中国红十字会第一医院儿科和中山医院儿科合并而成，原名上海第一医学院附属儿科医院，首任院长为国家儿科学一级教授陈翠贞。建院初期，以肇家浜路西门妇孺医院分院旧址为院址，1954年枫林路183号新医院启用。2000年4月原上海医科大学与复旦大学合并，更名为复旦大学附属儿科医院。医院设施优良，人才云集，是集医教研防为一体的综合性儿童专科医院，系... [收起]