广西治疗甲状腺囊肿比较好的三甲医院有1、广西壮族自治区肿瘤医院，2、南宁市第一人民医院，3、南宁市第二人民医院，4、广西妇幼保健院，5、桂林医学院附属医院等，甲状腺囊肿属于，广西壮族自治区肿瘤医院疾病医疗设施齐全，在疾病治疗方面有着丰富的经验；南宁市第一人民医院口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名广西壮族自治区肿瘤医院
广西医科大学附属肿瘤医院(广西壮族自治区肿瘤医院、广西壮族自治区肿瘤防治研究所、广西壮族自治区癌症中心)创建于1985年，是广西唯一一家省级肿瘤防治研究机构和三级甲等肿瘤专科医院。肿瘤学是国家重点(培育)学科、广西重点建设学科、广西高校“十二五”重点学科，肿瘤科是国家临床重点专科。现有广西临床重点专科2个，广西重点专科1个，广西医疗卫生重点学科5个，广西质量控制中心7个，广西结直肠癌临床医学研究中心1个，广西肝癌诊疗工程技术研究中心1个。
第二名南宁市第一人民医院
宁市第一人民医院始建于1914年，是一所集医疗、教学、科研、预防保健、康复于一体的大型三级甲等综合医院，拥有自治区临床重点专科6个（肾内科、重症医学科、神经内科、临床护理、骨科、血液内科），自治区妇幼健康重点学科2个（儿内科、产科），南宁市重点学科4个（呼吸内科、心血管疾病诊疗中心、神经外科、医学检验科），南宁市临床特色优势专科1个(骨与软组织肿瘤专科)，南宁市质控中心5个（南宁市护理质控中心、南宁市重症质控中心、南宁市血液净化质控中心、南宁市感控质控中心、南宁市临床检验中心）
第三名南宁市第二人民医院
南宁市第二人民医院（广西医科大学第三附属医院、广西医科大学第三临床医学院）始建于1952年，是一所集医疗、急救、教学、科研、预防、保健、康复为一体的三级甲等综合性医院。医院医疗集团包括院本部、市儿童医院、市第二妇幼保健院、市第二人民医院五象医院、江南区人民医院、良庆区人民医院、空港医院、良庆镇中心卫生院、蟠龙西邻家广场服务中心社区医院、福建园社区卫生服务中心、大沙田街道前进社区卫生服务中心。目前医院编制床位数为2025张（其中院本部1160张、五象院区365张、龙岗院区500张）。
第四名广西妇幼保健院
广西壮族自治区妇幼保健院建立于1965年1月，历经50多年的发展，现已成为集保健、医疗、科研、教学和基层妇幼保健指导为一体的三级甲等妇幼保健院，医院加强学科专科建设，妇科、儿科、重症医学科、产科先后成为广西临床重点专科；妇科、产科、新生儿科、儿童保健科、医学遗传学科、超声影像科6个学科成为广西妇幼健康服务重点学科。
第五名桂林医学院附属医院
桂林医学院附属医院创建于1958年5月，是一所集医疗、教学、科研、预防、康复、急救为一体的综合性三级甲等医院。设有46个临床专业科室，9个医技科室，58个专科、专病门诊，18个临床教研室，1个康复系；有紧密型医联体5个；有国家中医药科研二级实验室1个，省级重点实验室2个，广西高校重点实验室1个，广西高校重点实验室培养基地1个，广西高校协同创新中心1个，广西卫生计生委重点学科1个、重点建设学科2个，广西医疗卫生重点学科1个、重点培育学科3个，广西教育厅重点学科2个、优势特色重点学科2个，省级临床重点专科14个。 [收起]