福建治疗小阴茎比较好的三甲医院有1、福建省妇幼保健院，2、厦门大学附属第一医院，3、中山医院，4、厦门市妇幼保健院，5、厦门眼科中心等，小阴茎属于，福建省妇幼保健院疾病医疗设施齐全，在疾病治疗方面有着丰富的经验；厦门大学附属第一医院口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名福建省妇幼保健院
福建省妇幼保健院（福建省妇儿医院）位于道山路18号。为全国首家三级甲等妇幼保健院，全国首批爱婴医院。占地面积约2.97万平方米，建筑面积8.97万平方米，编制床位1000张，实际开放床位数950张。全院核定人员编制1346名，截至2018年12月31日共有职工1587人，其中编内1203人，编外384人，专业技术人员1478人，高级专家224人，其中正高64人，副高160人，有10名高级专家享受政府特殊津贴。2018年医院门诊量183.32万人次，住院人数5.80万人，分娩1.78万例，手术例数
第二名厦门大学附属第一医院
医院有内、外、妇、儿、急诊、护理等25个临床教研室，现有临床教师1034人，博士生导师、硕士生导师107人，在院规培生及进修实习医学生1800余人（全市第1，全省第4）。现有20个国家级住院医师规范化培训基地，基地数量在闽西南地区最多最全。
第三名中山医院
厦门大学附属中山医院（以下简称中山医院）始建于1928年，由爱国华侨和地方知名人士为弘扬中山先生“天下为公，造福社会”的精神捐资兴建而成，时任厦门大学校长、医学专家林文庆博士出任首任院长，2005年成为厦门大学首家附属医院，现已发展成为拥有4个院区（院本部、金榜分部、厦禾分部、环东海域医院[在建]），5家社区卫生服务中心，集医疗、教学、科研、预防保健于一体的三级甲等综合性医院和世界知名高水平研究型大学附属医院。
第四名厦门市妇幼保健院
厦门市妇幼保健院、林巧稚妇儿医院，是厦门大学附属妇女儿童医院。医院坐落于美丽的鹭江之畔，与“海上花园”鼓浪屿隔海相望。医院创建于1959年，建筑面积6.3万平方米，是集保健、医疗、教学、科研为一体的大型三级甲等妇幼保健院，承担着为全市妇女、儿童提供保健及医疗服务、指导培训基层妇幼保健工作、统计全市妇幼卫生信息、健康教育、教学、科研等任务。努力降低孕产妇死亡率、婴儿死亡率，优生优育，提高出生人口素质，提高妇女儿童健康水平。
第五名厦门眼科中心
　厦门大学附属厦门眼科中心成立于1997年11月8日，是集医疗、教学、科研、防盲为一体的三级甲等眼科医院、国家临床重点专科、国家药物临床试验机构。设有国家博士后科研工作站、院士专家工作站、全国住院医师规培基地、转化医学研究所等。 　　中心拥有员工近千人，几年来我院不断引进国内外高级眼科人才，九个亚专科已形成了老、中、青结合的学术梯队，博士生、硕士生导师十几人，并特聘国内外眼科名家组成专家顾问组... [收起]