广东治疗食管穿孔比较好的三甲医院有1、南方医科大学南方医院，2、广州中医药大学第一附属医院，3、广东省中医院，4、广东省人民医院，5、广州军区总医院等，食管穿孔属于，南方医科大学南方医院疾病医疗设施齐全，在疾病治疗方面有着丰富的经验；广州中医药大学第一附属医院口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名南方医科大学南方医院
南方医科大学南方医院是一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院,全国百佳医院。医院设置诊疗科目111个,拥有临床医学一级学科博士学位授权点和临床医学博士后流动站;内科学(消化系病)为国家重点学科,外科学(骨外)为国家重点培育学科;拥有国家临床重点专科建设项目14个,国家中医重点学科4个;设有器官衰竭防治省部共建国家重点实验室、慢性肾病国家临床医学研究中心,国家高等院校学科创新引智基地1个,广东省肾脏病研究所、南方消化病研究所、广东省肝脏疾病研究所。广东省临床重点专科达31个,临床医学获评广东省攀峰重点学科,口腔临床医学获评广东省优势重点学科。
第二名广州中医药大学第一附属医院
广州中医药大学第一附属医院是一所大型综合性中医医院，创建于1964年，是我国高等中医药临床教育、医疗、科研重要基地之一，为全国首批三级甲等中医医院、示范中医医院和首批广东省中医名院。医院拥有卫生部国家临床重点专科7个（内分泌科、耳鼻喉科、骨伤科、脾胃病科、妇科、肿瘤科、临床药学）、国家中医药管理局重点专科14个（急诊科、内分泌科、耳鼻喉科、骨伤科、肿瘤科、妇科、心血管科、针灸科、脾胃病科、脑病科、风湿病科、重症医学科、护理学、临床药学），已进入国家重点专科专病单位数量最多的医院行列，其中多个专科专病成为全国协作组组长或副组长单位；拥有省级重点专科专病27个。
第三名广东省中医院
广东省中医院(广州中医药大学第二附属医院、广州中医药大学第二临床医学院)始建于1933年,是我国近代史上最早的中医医院之一,被誉为“南粤杏林第一家”。　广东省中医院形成了一百多个特色鲜明、疗效明显的专科专病,其中脑病专科、心血管病专科、皮肤病专科、肾病专科、乳腺病专科、妇科病专科、脊柱专科、中医急症、颈椎病(脊柱)专科、骨病骨肿瘤专科、骨关节病专科、消化病专科、呼吸病专科、肿瘤病专科、耳鼻喉病专科、中医外科、针灸科、糖尿病专科、肝病专科、冠心病专科等是国家级和省级的重点专科,在国内和省内处于领先地位。
第四名广东省人民医院
广东省人民医院（广东省医学科学院）创建于1946年，下辖2个分院、6个门诊部和6个研究所，托管2家基层医院， 医院各专科亚专科设置齐全，共有12个国家临床重点专科、34个广东省临床医学重点专科/学科。我院2017年度全国最佳医院排行榜（复旦版）综合排名第29名，位居全国省级人民医院前列；排名进入全国前十的专科共5个：心外科（全国第3名）、心血管病（全国第4名）、老年医学（全国第6名）、急诊医学（全国第6名）、放射科（全国第9名）；专科提名获全国前十的有胸外科、风湿科、肿瘤学和康复医学。
第五名广州军区总医院
广州军区总医院始建于1933年，是全国、全军首批三级甲等医院，医院设有60个专科，年门诊量125万人次。现拥有1个国家重点专病中心及2个博士后科研工作站；创建了创伤骨科中心、呼吸内科中心、临床麻醉中心、心血管病中心中心、激光整形中心、神经外科中心、下尿路疾病诊疗中心、辅助生育中心和临床护理培训中心9个全军医学专科(病)中心及全军临床药理基地、卫生信息技术基地；打造了12个军区医学研究所和专科中心、骨科被评为广东省重点专科，泌尿外科、心血管内科、中医科和药剂科被评为广东省特色专科。 [收起]