1.南京市中医院中医科

南京市中医院成立于1956年，是一所中医特色明显、中西医结合、集医疗服务功能和急救能力为一体的三级甲等中医院。设有临床及医技科室38个，其中国家级重点学科：中医肛肠病学，国家级重点专科7个；江苏省重点学科：中医脑病学，江苏省重点专科8个，南京市中医重点专科14个。

2.东南大学附属中大医院中医科

东南大学附属中大医院始建于1935年，其前身为中央大学医学院附设医院，医院拥有国家临床重点专科重症医学科、医学影像学；江苏省优势学科医学技术学；江苏省重点学科：临床医学；江苏省临床重点专科介入放射科、普通外科、心血管内科、骨科、血液内科、急诊医学科、消化内科、肾脏内科、神经内科、内分泌科、麻醉科、肿瘤科、重症医学科、整形外科、病理科、儿科、妇产科、医学影像科、泌尿外科、呼吸内科。

3.南京医科大学第二附属医院中医科

南京医科大学第二附属医院，暨江苏省第二红十字医院、南京医科大学第二临床医学院，是江苏省卫生健康委直属的三级甲等综合医院，现有临床科室37个，其中省级临床重点专科15个（含建设单位），分别为消化内科、小儿内科、肾脏内科、妇产科、老年医学科、内分泌科、肿瘤科、泌尿外科、眼科、耳鼻咽喉科、心血管内科、神经内科（建设单位）、普外科（建设单位）、医学影像科（建设单位）、呼吸内科（建设单位）。

4.南京市第一医院中医科

南京市第一医院（南京医科大学附属南京医院、中国药科大学南京市第一医院），是卫生部首批三级甲等综合性医院。现有国家重点学科1个，国家临床重点专科1个，江苏省医学重点学科4个，江苏省专科（病）诊疗中心1个，南京医科大学重点学科4个，江苏省省级临床重点专科20个，南京市医学重点学科2个，南京市医学重点专科8个，博士培养点14个，硕士培养点30个，国家级博士后科研工作站1个，院士工作站6个。

5.盐城市第三人民医院中医科

盐城市第三人民医院暨盐城市红十字医院，是一所集医疗、教学、科研、预防保健、康复为一体的三级甲等综合医院，设32个临床科室、12个医技科室、42个病区。现有介入放射科、心血管内科、消化内科、医学检验科、心胸外科、神经内科、麻醉科、康复医学科等8个省级临床重点专科，另有内分泌科、呼吸内科、血液内科、肾内科、肿瘤科、普外科、骨科、神经外科、泌尿外科、妇产科、儿科、新生儿科、重症医学科、感染性疾病科、放疗科、肛肠科、医学影像科、药学科、超声诊断室、病理科等20个优势学科为市级医学重点学科和临床重点专科。