江苏治疗直肠肛管先天性疾病比较好的医院有1、徐州市中心医院，2、淮安市第一人民医院，3、南通大学附属医院，4、南京医科大学第二附属医院，5、无锡市人民医院等，直肠肛管先天性疾病属于儿科，徐州市中心医院儿科疾病医疗设施齐全，在儿科疾病治疗方面有着丰富的经验；淮安市第一人民医院儿科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名徐州市中心医院儿科
徐州市中心医院（四院）是一家三级甲等综合医院。拥有86个临床专业（病区）、27个医技专业。其中国家内镜与微创医学培训基地8个：泌尿外科、普外科、骨科、妇产科、胸外科、耳鼻喉头颈外科、消化内科、血管介入科；省级临床重点专科20个：心血管内科、急诊医学科、口腔科、康复科、泌尿外科、内分泌科、妇科、肿瘤内科、骨科、影像科（放射科、超声科、CT核磁、介入微创外科）、中医科、儿科、产科、放疗科、呼吸内科、重症医学科、肾内科、麻醉科、医学检验科、神经内科。
第二名淮安市第一人民医院儿科
淮安市第一人民医院，又名南京医科大学附属淮安第一医院是一所大型三级甲等综合性医院，拥有省级临床重点专科13血液内科、普通外科(包括肝胆外科、胃肠外科、甲状腺乳腺外科)、肿瘤内科、医学影像科、神经外科、心胸外科、内分泌科、儿科、产科、消化内科、神经内科、医学检验科、耳鼻咽喉科。市级临床重点专科15个：消化内科、医学检验科、骨科、耳鼻咽喉科、肿瘤放疗科、妇科、急诊医学科、病理科、呼吸内科、烧伤整形科、眼科、泌尿外科、免疫风湿科、心血管内科、肾内科。 
第三名南通大学附属医院儿科
南通大学附属医院手外科为江苏省临床医学研究中心；神经疾病诊疗中心为江苏省“科教强卫工程”十大“临床医学中心”之一，手外科、医学检验科、血液科、眼科为省“科教强卫工程”医学重点学科；普外科、骨科、眼科、消化内科、血液内科、医学检验科、心血管内科、神经内科、皮肤科、肾脏内科、呼吸内科、妇产科、神经外科、急诊医学科、医学影像科、耳鼻咽喉科、心胸外科、整形外科、重症医学科、风湿免疫科、康复科、儿科、病理科、麻醉科、肿瘤科、泌尿外科等26个专科为省级临床重点专科。
第四名南京医科大学第二附属医院儿科
南京医科大学第二附属医院，暨江苏省第二红十字医院、南京医科大学第二临床医学院，是江苏省卫生健康委直属的三级甲等综合医院，现有临床科室37个，其中省级临床重点专科15个（含建设单位），分别为消化内科、小儿内科、肾脏内科、妇产科、老年医学科、内分泌科、肿瘤科、泌尿外科、眼科、耳鼻咽喉科、心血管内科、神经内科（建设单位）、普外科（建设单位）、医学影像科（建设单位）、呼吸内科（建设单位）。
第五名无锡市人民医院儿科
江苏省无锡市人民医院一家三级甲等现代化综合医院。全院共设有58个临床科室，15个医技科室，拥有省级诊疗中心肺移植科；省级临床重点学科2个：器官移植外科（肺移植）、眼科；省级临床重点专科21个：心血管内科、血液科、内分泌科、消化内科、呼吸内科、泌尿外科、普外科（肝胆外科）、胸外科、神经外科、眼科、医学影像科、医学检验科、麻醉科、重症医学科、肾内科、普外科、神经内科、病理科、儿呼吸科、儿普外科、新生儿科。市级临床重点专科8个超声医学科、风湿免疫科、急诊医学科、老年病专业、肿瘤科、药剂科、儿急诊科、儿童保健康复科。 [收起]