北京治疗肝吸虫病比较好的三甲医院有1、陆军总医院，2、北京市丰台中西医结合医院，3、中国医学科学院肿瘤医院，4、中国人民解放军总医院第八医学中心，5、北京大学第一医院等，肝吸虫病属于外科，陆军总医院外科疾病医疗设施齐全，在外科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京市丰台中西医结合医院外科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名陆军总医院外科
陆军总医院成立于1913年，分东、西两院。东院位于北京市东三环麦子店，西院位于北京市东四繁华商业区，是一所历史悠久、设备精良、技术先进，集预防、保健、医疗、科研、教学、康复为一体的大型综合性医院。床位1600余张;下设50个专科、70多个专业，是解放军第二军医大学北京临床医学院、第三、第四军医大学临床教学医院，1995年5月被总后勤部授予“三级甲等医院”，2001年被北京市确定为首批医疗保险定点医院。
第二名北京市丰台中西医结合医院外科
北京市丰台区长辛店医院建于1975年3月，是一所集医疗、预防、康复、科研、教学为一体的综合性二级医院。拥有25个临床科室、10个医技科室。在岗职工576人，其中专业技术人员487人，副高以上职称57人，医学硕士、博士(博士后)共90人，国家级名老中医传承人1人，市级名老中医传承人1人，区级名老中医传承人3人，院级名老中医传承人8人。
第三名中国医学科学院肿瘤医院外科
中国医学科学院肿瘤医院，始建于1958年，原名日坛医院。1963年增设肿瘤研究所，此后又相继建立了河南林州、江苏启东等肿瘤高发防治现场。1983年迁至北京市东南龙潭湖畔，更名为中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所，1996年通过三级甲等医院评审。中国医学科学院肿瘤医院是建国以来第一家肿瘤专科医院、亚洲地区最大的肿瘤防治研究中心，是国家临床医学研究中心、国家肿瘤规范化诊治质控中心、国家食品药品监督管理局认证的国家药物临床研究基地，是集医教研防于一体，全方位开展肿瘤相关基础研究和临床诊治的国家标志性肿瘤专科医院。
第四名中国人民解放军总医院第八医学中心外科
总参谋部总医院(解放军第309医院)是京西北地区唯一的三级甲等综合医院，医院目前展开床位1430余张，设置有国家和军队重点学科全军结核研究所、全军器官移植研究所、全军骨科中心等45个专业学科，年均门急诊约140余万人次、收容住院4万余人次、手术例数达2万余人次。
第五名北京大学第一医院外科
北京大学第一医院(北大医院)位于北京老皇城内，是距离中南海最近的医院，是一所融医疗、教学、科研、预防为一体的大型综合性三级甲等医院。拥有着一批国内的首创专业学科以及在我国率先开展的诊疗技术，如国内首创小儿科(1940)、泌尿外科、肾脏病专业、综合医院心血管病房、小儿神经专业等。 [收起]