北京治疗直肠癌比较好的三甲医院有1、北京大学第三医院，2、首都医科大学附属北京朝阳医院西院，3、中国医学科学院肿瘤医院，4、北京市平谷区中医医院，5、中国中医科学院广安门医院等，直肠癌属于肛肠科，北京大学第三医院肛肠科疾病医疗设施齐全，在肛肠科疾病治疗方面有着丰富的经验；首都医科大学附属北京朝阳医院西院肛肠科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京大学第三医院肛肠科
北京大学第三医院建于1958年，国家卫生健康委委管医院，集医疗、教学、科研、预防、康复与保健为一体的综合性三甲医院。2018年底，在岗职工5157人，开放床位1891张。医院有36个临床科室、10个医技科室。有27个博士点、1个临床博士后流动站。在岗博士生导师57人，中国科学院院士1人、中国工程院院士2人，国家千人计划1人，国家自然科学基金杰出青年基金获得者3人、科技部“973”首席科学家1人、教育部“长江学者特聘教授”2人，2人入选国家级“新世纪百千万人才工程”，青年千人计划1人，国家自然科学基金优秀青年科学基金获得者4人，卫生部突出贡献专家10人。
第二名首都医科大学附属北京朝阳医院西院肛肠科
首都医科大学附属北京朝阳医院创建于1958年2月24日，是北京市卫生 局直属医院，是集医疗、教学、科研、预防为一体的三级甲等医院，是首都医科大学第三临床医学院，医疗特色学科包括呼吸病学学科（国家重点学科）、心脏病学学科、泌尿病学学科、职业病与中毒医学学科、高压氧医学学科、器官移植学科、急诊医学学科、危重症医学学科、病理产科、检验医学学科，其中多个被确定为北京市重点学科、北京市医学重点学科或北京市医学重点扶植学科。
第三名中国医学科学院肿瘤医院肛肠科
中国医学科学院肿瘤医院，始建于1958年，原名日坛医院。1963年增设肿瘤研究所，此后又相继建立了河南林州、江苏启东等肿瘤高发防治现场。1983年迁至北京市东南龙潭湖畔，更名为中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所，1996年通过三级甲等医院评审。中国医学科学院肿瘤医院是建国以来第一家肿瘤专科医院、亚洲地区最大的肿瘤防治研究中心，是国家临床医学研究中心、国家肿瘤规范化诊治质控中心、国家食品药品监督管理局认证的国家药物临床研究基地，是集医教研防于一体，全方位开展肿瘤相关基础研究和临床诊治的国家标志性肿瘤专科医院。
第四名北京市平谷区中医医院肛肠科
平谷区中医医院始建于1986年，是一所集中、西医医疗、康复、教学、科研为一体的综合性二级甲等中医医院，在医疗建设中，坚持以中医为主，中西医结合的方针，坚持突出中医特色和发挥中医药优势。以中药、针灸、推拿、康复训练、药治等中医传统疗法为主，结合现代医疗手段开展临床医疗。特别是在专科专病建设上，针灸科、康复科、推拿科、骨伤科、肛肠科等专科特色医疗，已被社会广泛认可。
第五名中国中医科学院广安门医院肛肠科
中国中医科学院广安门医院(暨中国中医科学院第二临床医药研究所)始建于1955年，是国家中医药管理局直属的集医疗、教学、科研和预防保健为一体的三级甲等中医医院，医院设有风湿病科、内分泌科、心血管科、肾内科、呼吸科、脾胃病科、外科、妇科、儿科、肛肠科、肿瘤科、眼科、骨科、皮肤性病科、泌尿男科、针灸科、耳鼻喉科、心理科、心身医学科、口腔科、手术麻醉科、急诊科、感染疾病科、肝炎门诊、肠道门诊和艾滋病。 [收起]