上海治疗肛肠科排名靠前的三甲医院有1、上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院，2、上海长海医院，3、上海交通大学医学院附属第九人民医院，4、上海交通大学医学院附属仁济医院，5、上海中医药大学附属曙光医院等，上海肛肠科医院排名是根据复旦医院排名、卫健委、患者口碑等要素综合产生，其中上海长海医院是全国医院综合实力排行榜第39名，上海交通大学医学院附属第九人民医院是全国医院综合实力排行榜第23名，上海交通大学医学院附属仁济医院是全国医院综合实力排行榜第17名。
第一名上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院肛肠科
上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院是集医疗、教学、科研为一体的三级甲等中西医结合综合性医院。目前医院拥有中医内科、中医外科、西医外科、妇科、儿科等27个临床科室，8个医技科室，设有各级各类专科专病门诊99个。拥有国家教育部重点培育学科1个（针灸推拿学），国家中医药管理局重点学科3个（中西医结合临床学科、推拿学科、针灸学科）、重点专病专科7个（中医妇科、血液科、康复科、推拿科、针灸科、痛风、胃食管返流病）、上海市临床医学中心1个（上海市针灸推拿临床医学中心）、上海市重点学科2个（针灸推拿学、中医妇科）、上海市中医特色专科7项。上海市首席名中医工作室1个、上海市名中医工作室5个。
第二名上海长海医院肛肠科
长海医院是一所集医疗、教学、科研为一体的现代化大型综合性医院。1993年首批进入三级甲等医院行列，学科综合实力雄厚，下辖1个中医系、51个建制科室、展开床位2100余张，拥有一批现代化顶尖诊疗设备；现有15个国家重点学科，其中牵头建设的国家重点学科6个（烧伤外科、胸心外科、消化内科、泌尿外科、中医科、影像科），参与建设的国家重点学科9个（骨科、神经外科、整形外科、普外科、感染科、核医学科、病理科、药材科、外科学及野战外科学教研室）；现有17个全军医学专科研究所（中心），12个上海市级重点学科、中心。
第三名上海交通大学医学院附属第九人民医院肛肠科
上海交通大学医学院附属第九人民医院的前身“伯特利医院”创建于1920年。九院是一所以口腔、整复外科、骨科和眼科为特色的内、外、妇、儿各科齐全的三级甲等综合性教学医院。医院积极响应政府号召，坚持公立医院公益性办院，近年来九院在援摩、援滇、援疆和支持市郊奉城医院的医疗工作中，取得良好的社会效益。九院连续十一届评为上海市文明单位。2012年复旦大学医院管理研究院公布的《2011年度中国最佳医院及最佳专科声誉排行榜》我院排名全国第21名（100家医院）；整复外科荣获《中国医院最佳专科声誉排行榜》第1名、口腔医学荣获第3名，骨科、眼科分别获得全国最佳专科提名。
第四名上海交通大学医学院附属仁济医院肛肠科
上海仁济医院建于1844年,是上海开埠后第一所西医医院。医院目前由东西南北四个院区和上海市肿瘤研究所组成,是一个学科门类齐全,集医疗、教学、科研于一体的综合性三级甲等医院。医院设有42个临床医技科室：消化科、心内科、血液科、风湿病科、老年病科、呼吸科、肾脏科、神经内科、内分泌科、肿瘤科、康复科、急诊科、核医学科、放射诊疗科、泌尿科、普外科、骨科、心血管外科、胸外科、血管外科、神经外科、肝脏外科、整形外科、麻醉科、中医科、儿科、眼科、妇产科、生殖医学科、耳鼻咽喉-头颈外科、皮肤科、感染科、口腔科、营养科、放射科、超声医学科、病理科、检验科、药剂科、输血科、内科门诊、健康保健中心。
第五名上海中医药大学附属曙光医院肛肠科
上海中医药大学附属曙光医院是沪上一所百年老院，三级甲等综合性中医院，省部共建研究型中医院，位列上海十大综合性医院之一，全国示范中医院，现拥有国家教育部重点学科3个：中医骨伤科学、中医内科学、中药学（中药制剂、中药临床药理）。国家中医药管理局重点学科9个，卫健委临床重点专科6个，中管局重点专科14个。中医急诊科是国家中医药管理局急诊基地，制剂室是全国中药制剂和剂改基地，神经内科是卫健委脑卒中防治基地。医院开设的专病专科各具特色，独树一帜，享誉全国。 [收起]