福建治疗肠毒性大肠杆菌感染比较好的三甲医院有1、福州市第一医院，2、泉州市中医院，3、泉州市第一医院，4、福建医科大学附属第二医院，5、三明市第一医院等，肠毒性大肠杆菌感染属于内科，福州市第一医院内科疾病医疗设施齐全，在内科疾病治疗方面有着丰富的经验；泉州市中医院内科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名福州市第一医院内科
福建医科大学附属福州市第一医院前身系1898年英国圣公会创办的福州柴井基督医院，是福州市属三级甲等综合医院， 医院医疗技术雄厚，拥有妇科、产科、肛肠科等3个省级重点专科，产科、妇科、呼吸与危重症医学科、消化内科、新生儿科、心血管内科、肾内科7个市级临床重点专科，配备有中心ICU和神经重症、产科重症、心脏重症、新生儿重症等多个学科ICU及救治系统，是福州市产前诊断中心、福州市产科危重症转诊机构。
第二名泉州市中医院内科
泉州市中医院创建于1953年，是泉州市第一中医诊所的前身，在市委市政府和市卫计委的坚强领导下，于1983年整合市人民医院中医药部分和市中医门诊部，创建泉州市中医院，1995年被国家中医药管理局批准为“全国示范中医院”和“三级乙等”中医医院，2014年批准为“三级甲等”中医医院。
第三名泉州市第一医院内科
泉州市第一医院（福建医科大学附属泉州第一医院）创建于1936年，为一所融医疗、教学、科研和预防保健为一体的三级甲等综合医院，医院设有四个院区（东街院区、城东院区、妇产院区、老年病分院），开放床位2305张。现有员工3398人，其中高级职称人员439人，中级职称771人；博士、硕士674人。国家级学术团体副主委、常委、委员105人，省级学术团体主委、副主委、常委140人。泉州市高层次人才137人，泉州培养型人才80人。
第四名福建医科大学附属第二医院内科
福建医科大学附属第二医院始建于1881年，原名“惠世医院”，为英国教会医院。1973年隶属福建医科大学成为附属第二医院。医院是福建省首批通过卫生部评审的四家三级甲等综合医院之一，是我省主要的医疗、教学、科研、毕业后教育基地之一，是博士、硕士研究生学位授权点单位，是福建省南部区域医疗中心领衔医院、福建省呼吸医学中心建设依托医院。
第五名三明市第一医院内科
三明市第一医院始建于1960年，历经50余载的拼搏进取，现已发展成为一家三级甲等综合性医院设有46个临床科室、17个医技科室。现有职工2228人，其中专业技术人员2058人，占全院职工92％，高级职称人员368人，医学博士、硕士132人。 [收起]