1.福建协和医院

福建医科大学附属协和医院福建省血液病、内分泌、肝胆外科、胸心外科等11个省级研究所及其他11个校级研究机构挂靠医院。承担大量国家、省、部级科研项目，先后获得3项国家科技进步奖、国家自然科学奖，430余项省、部级等科研成果奖。协和临床医学院承担福建医科大学各相关专业的临床教学任务，福建省最早的临床医学博士、硕士点发端于我院，是国家临床教学培训示范中心、国家级住院医师、专科医师规范化培训基地、中国医师协会腹腔镜外科医师培训基地。

2.福建中医药大学附属人民医院

福建省人民医院（暨福建中医药大学附属人民医院）坐落于历史文化名城、海峡西岸经济区中心城市福州，毗邻上下杭历史文化街区，创办于1954年12月，是福建省人民政府创办的首家公立医院，也是福建省首家三甲中医院。历经一甲子沧桑岁月的洗礼，几代人筚路蓝缕的不懈努力，积淀了深厚的文化底蕴。现已发展成为一所名家百家辈出，中医特色鲜明，综合实力雄厚，集医疗、教学、科研、预防、康复为一体的三级甲等综合性中医院。2018年位列全国中医医院百强第26位。

3.福州市第二医院

始建于1866年的福州市第二医院，是一所以骨科为龙头，集医疗、科研、教学、预防、康复为一体的三级甲等医院，前身为英国皇家海军、英国领事馆合办的“海港医馆”；1887年易名为“塔亭医院”；1956年3月定名为“福州市第二医院”；2012年4月成为厦门大学非直属附属医院。经过多年不懈的努力，医院在医疗技术、设备、服务、环境、人才培养、医院管理等方面均取得跨越式的发展，荣获“全国卫生系统先进集体”、“福建省级文明单位”等多项荣誉称号。

4.福建省第二人民医院

福建省第二人民医院又名福建中医药大学第二临床医学院,是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性中医医院,医院拥有一批特色鲜明,疗效显著的重点专科与学科,康复科、脾胃科、颈椎病、肾病科、肛肠科为国家级重点专科(专病),心衰专病、脑病科、呼吸科、妇产科为省级重点专科(专病),中医骨伤病学专业是福建省211工程唯一的中医临床重点学科;体检中心,血液净化科、中医皮肤科居福建省领先水平。泌尿、神经外科、乳腺、甲状腺、眼耳鼻咽喉、断指再植、老年医学、医学美容、介入及超声等专业优势明显。

5.福建省妇幼保健院

福建省妇幼保健院（福建省妇儿医院）位于道山路18号。为全国首家三级甲等妇幼保健院，全国首批爱婴医院。临床部下设妇科、产科、儿科、新生儿科、外科等临床科室，检验科、影像科、超声科等医技科室。医院计划生育、产科为福建省临床重点专科，开展宫腔镜、腹腔镜、阴道镜、高频电波刀宫颈疾病诊治技术、显微输卵管复通术等妇产科诊疗技术，在高危妊娠的监测与处理、妇科复杂手术等方面有丰富的临床经验。医院建立妇科肿瘤实验室，开展妇科肿瘤研究，为妇科肿瘤早期诊断与治疗提供科学依据。