北京治疗儿童顿咳比较好的三甲医院有1、首都儿科研究所附属儿童医院，2、北京中医药大学附属护国寺中医医院，3、北京市丰台中西医结合医院等，儿童顿咳属于中医科，首都儿科研究所附属儿童医院中医科疾病医疗设施齐全，在中医科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京中医药大学附属护国寺中医医院中医科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名首都儿科研究所附属儿童医院中医科
首都儿科研究所是一所以医学基础研究、儿科疾病发病机理研究、儿童保健为重点，承担有医疗、教学和预防任务的应用医学研究机构。其前身是中国医学科学院儿科研究所 ,成立于1958年，是新中国第一家儿科医学研究所。于1983年隶属北京市，1984年开设门诊，1986年建立附属儿童医院。1993年，在京郊顺义区组建“北京市医用生物制品中试基地”。研究所先后10次获得北京市属科研院所“改革与发展”一等奖，18次获得首都及卫生系统“文明单位”的称号。50多年来，经过几代人的不懈奋斗，研究所已发展成为集儿科基础医学、临床医学、高等医学教育、预防保健医学为一体的全国知名的医学研究机构。
第二名北京中医药大学附属护国寺中医医院中医科
护国寺中医医院是北京市最早的公立中医医疗机构。早在六十年代，就作为北京中医学院(现北京中医药大学)的教学、实习医院，医院开设有内、外、针灸、肿瘤、骨科8个病区;门诊设有内、外、针、骨、妇、儿、皮、眼、五官、口腔、急诊及放射、CT、检验、心电、超声、心脑功能捡查、手术室、中西药房、中西药制剂等科室20余个;有普通门诊、专家门诊为患者提供优质服务，全国著名中医内科专家许彭龄教授等众多专家定期应诊。
第三名北京市丰台中西医结合医院中医科
北京市丰台区长辛店医院建于1975年3月，是一所集医疗、预防、康复、科研、教学为一体的综合性二级医院。拥有25个临床科室、10个医技科室。在岗职工576人，其中专业技术人员487人，副高以上职称57人，医学硕士、博士(博士后)共90人，国家级名老中医传承人1人，市级名老中医传承人1人，区级名老中医传承人3人，院级名老中医传承人8人。 [收起]