湖南治疗胎儿先天畸形比较好的三甲医院有1、湖南中医药大学第一附属医院，2、湖南省生殖医学研究院，3、长沙市妇幼保健院，4、衡阳市妇幼保健院，5、益阳市中心医院等，胎儿先天畸形属于儿科，湖南中医药大学第一附属医院儿科疾病医疗设施齐全，在儿科疾病治疗方面有着丰富的经验；湖南省生殖医学研究院儿科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名湖南中医药大学第一附属医院儿科
湖南中医药大学第一附属医院创建于1963年，是“七五”期间全国七所重点项目建设的中医院之一，2008年入选国家中医临床研究基地，2017年入选“中医药传承创新工程”项目建设单位。经过历代中医附一人的不懈努力，医院事业不断发展，现已成为一所中医特色突出、综合功能完善、名老中医荟萃，重点专科云集、研究创新能力强、管理规范的现代化、综合性、研究型中医医院，成为湖南省首家三级甲等中医医院、湖南省中医及中西医结合医、教、研中心和龙头，医院的中医特色和综合能力建设已跻身全国中医医院先进水平。医院占地面积110亩，现有建筑面积24万平方米，编制床位1800张，年门诊人次160余万人次，年住院人次近7万。
第二名湖南省生殖医学研究院儿科
湖南省妇幼保健院成立于1947年，是湖南省卫生健康委直属的集医疗、妇幼保健、临床教学、科研于一体的三级甲等妇幼保健院，是国家博士后工作站、国家住院医师培训专业基地、国家药物临床实验基地（GCP）、国家级爱婴医院、国家级母婴友好医院。医院担负着全省妇女儿童的保健、医疗、健康教育、科研教学、妇幼保健基层技术指导、妇幼卫生人员培训、妇幼卫生信息管理等多项任务,对全省14个市州、122个县的妇幼保健机构进行业务管理和技术指导，是湖南省妇幼保健技术指导的龙头单位。
第三名长沙市妇幼保健院儿科
我院始建于1962年，1987年由所改院，地址位于长沙市雨花区城南东路416号，长沙市卫生健康委直属副县级全民事业单位，目前占地面积1.53万平方米，建筑面积4.01万平方米，编制床位600张，在岗人员1097人，是一所集预防、保健、医疗、康复、科研和教学为一体三级甲等妇幼保健院，作为长沙市妇幼保健计划生育服务中心，肩负着全市三县（市）六区妇幼卫生和计划生育工作的业务管理与指导任务。
第四名衡阳市妇幼保健院儿科
衡阳市妇幼保健院（衡阳市儿童医院）建院于1953年，2012年通过三级甲等妇幼保健机构评审，系衡阳地区唯一一家集妇幼保健、医疗、教学、科研于一体的三级甲等专科医院。医院（解放路院区）现占地面积6.03亩，有在职员工713人，退休职工146人，拥有正高职称16人，副高职称80余人。设编制床位350张，实际开放222张。年门诊人次25万，住院人次1.3万。医院先后荣获全国爱婴医院、全国三八红旗集体、省文明单位、衡阳市消费者满意医院等五十多项殊荣。医院秉承诚信为本取之于民回报于民的办院理念，着力在提高医疗服务质量、严格收费管理、提高患者满意度上做文章。
第五名益阳市中心医院儿科
益阳市中心医院前身为挪威传教士倪尔生医师于1906年创办的“信义医院”，至今已有113年的建院历史，是一所集医疗、教学、科研、预防保健为一体的全市唯一综合性三级甲等医院。医院现为湘雅医学院益阳临床学院、南华大学研究生协作培养单位、南华大学临床教学医院、湖南省中以合作临床医学研究培育基地、全国百姓放心示范医院、国家临床药物试验基地、国家级全科医师培训基地、国家级住院医师规范化培训基地,是全国第一批获得国家卫健委器官移植准入资质机构，是益阳市区域医疗中心，益阳市智慧医疗远程医学中心。 [收起]