北京治疗十二指肠溃疡比较好的三甲医院有1、中国中医科学院西苑医院，2、北京积水潭医院，3、首都医科大学附属北京儿童医院，4、北京大学人民医院，5、北京中医药大学第三附属医院等，十二指肠溃疡属于外科，中国中医科学院西苑医院外科疾病医疗设施齐全，在外科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京积水潭医院外科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名中国中医科学院西苑医院外科
中国中医科学院西苑医院（简称“西苑医院”）创建于1955年12月，是新中国成立后由中央人民政府建设的第一所大型中医医院。经过60多年的发展，现已成为一所中医特色突出，诊疗优势明显，在国内国际具有较大影响力，集医疗、科研、教学、保健为一体的三级甲等综合性中医医院。
第二名北京积水潭医院外科
北京积水潭医院是一家王府花园式医院。以骨科和烧伤科为重点学科，内、外、妇、 眼、口腔、耳鼻喉、皮肤性病、中医内科、中医正骨、针灸、理疗康复科等并驾齐驱的三级甲等综合性医院(北京积水潭医院是北京市直属差额拨款事业单位，事业编制2900人。医院设有职能处室16个，其中内设管理部门5个，设有临床及医技科室53个，现实有在岗人员2519人，有院级领导9人，职能部门中层领导30人)。
第三名首都医科大学附属北京儿童医院外科
首都医科大学附属北京儿童医院是集医疗、科研、教学、保健于一体的三级甲等综合性儿科医院，前身是我国现代儿科医学奠基人诸福棠院士于1942年创办的北平私立儿童医院。医院总占地面积7万平方米，建筑面积12万平方米，编制病床970张，年门诊量300余万人次，住院病人7万余人次，手术逾2.3万例。2017年，医院被国家卫生健康委(原国家卫生计生委)批准成为国家儿童医学中心，2019年被批准设立国家儿童肿瘤监测中心，为儿童血液病、恶性肿瘤防控提供大数据支撑。
第四名北京大学人民医院外科
北京大学人民医院以建设医、教、研、管理与国际接轨的大学医院为战略目标，着力建设全国疑难急重症诊疗中心，临床医学教育创新示范基地，临床医学科学研发基地， 医院、医疗卫生体制改革探索、实验、示范基地。现已发展成为集医疗、教学、科研为一体的现代化综合性大学医院。医院正式员工总数2379人，中国工程院院士1名，编制床位1448张(开放床位1700余张)，设有40个临床科室、17个医技科室和25个职能处室。在学科建设方面，医院搭建支持平台、关注重点学科发展，形成了以11个国家教育部重点学科为龙头，以18个卫生部临床重点专科、5个北京大学级研究所、3个北京市重点学科、1个国家中医药管理局中医药重点学科以及国家级人才培养模式示范区、国家级特色专业示范点、国家级教学创新团队为战略支点，临床、教学、科研三大学科集群比肩并行的学科发展布局。
第五名北京中医药大学第三附属医院外科
北京中医药大学第三附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的三级甲等中西医结合医院。是国家中医药管理局重点中西医结合医院建设单位、教育部直属医院、北京中医药大学第三临床医学院。医院编制床位520张，有30个临床科室，5个医技科室， 4个门诊部，3个社区卫生服务站;医院有正高职称专家41名，副高职称专家72名，具有博士学位人员72名，硕士学位人员114名，医院有北京中医药大学经方现代临床应用研究所、北京中医药大学骨伤科研究所。 [收起]