江苏南京治疗肝脓肿比较好的三甲医院有1、江苏省中医院，2、南京市第二医院，3、中国人民解放军东部战区空军医院（原解放军四五四医院）等，肝脓肿属于肝病科，江苏省中医院肝病科疾病医疗设施齐全，在肝病科疾病治疗方面有着丰富的经验；南京市第二医院肝病科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名江苏省中医院肝病科
江苏省中医院（南京中医药大学附属医院）创建于1954年10月，为全国首批成立的省级中医医院之一，医院共有5名专家入选，4位专家入选2017年首届全国百名名中医，4位专家荣膺国家岐黄学者，成为国内拥有最多国医大师、最多全国名中医的医院。另有25名全国中医师承指导老师、国家级名医传承工作室专家，白求恩奖章获得者2名，中国医师奖获得者2名，享受政府特殊津贴专家37名，有省级名中医、名中西医结合专家60名，江苏省首批国医名师6名。
第二名南京市第二医院肝病科
南京市第二医院(南京中医药大学附属南京医院，徐州医科大学南京第二临床学院，东南大学附属第二医院)，属于三级甲等医院。医院有国家临床重点专科1个，省重点学科、专科7个，市重点专科4个。其中感染性疾病科为国家级临床重点专科，感染性疾病学为江苏省医学重点学科。传染科、肿瘤科、妇产科、普通外科、肝病科、结核科为江苏省省级临床重点专科，中西医结合科为江苏省示范中医科，肠道及其他传染病科、检验科、医学影像科、重症医学科为南京市临床重点专科。
第三名中国人民解放军东部战区空军医院（原解放军四五四医院）肝病科
东部战区空军医院始建于1951年，是南京首批综合性三级甲等医院，是南京市城镇职工医保、居民医保定点医院，南京市急救站分站，南京市劳动能力鉴定检查定点医院，省、市“三信三优”单位，省新农合省级联网医院，全军第二批宇航员遴选体检定点医院，全军交通医学研究所南京临床基地，安徽医科大学临床医院，第二、第四军医大学、江苏大学医学院、皖南医学院、蚌埠医学院、吉林医药学院教学医院医院率先导入国际先进的质量管理体... [收起]