1986年，在巴川镇卫生院基础上成立铜梁县中医院。1992年提出创建“二级甲等”中医院的目标，1996年12月20日，县中医院通过了国家中医医院分组管理委员会专家组的评审，成为重庆市首批“二级甲等”中医院。2002年，县中医院开始创建全国“十五”重点中西医结合骨伤科建设项目，于2006年10月29日通过国家中医药管理局专家组的评审验收，成为全国唯一一家通过国家级重点专科建设任务评审验收的县级中医院。2003年，县中医院在西南地区县级中医院中，率先导入ISO9000质量管理体系，2004年7月一次性通过评审认证，获得由中质协质量保证中心颁发的质量管理体系认证证书。该管理体系的导入，理顺了行政、人事、医疗、设备、药品等方面的管理秩序，使医院走上了科学化、制度化的管理轨道。2006年，县中医院利用奥地利政府贷款，购置了17台（套）先进医疗设备，总价值近2000万元人民币。目前，医院拥有GE1.5T超导核磁共振成像系统（MR），16层计算机断层X线扫描装置（CT），德国西门子多功能数字减影血管造影X线机（DSA）、数字化X线摄影系统（DR）、彩色多普勒超声诊断仪、全自动生化分析仪等先进诊疗设备，整体医疗设备水平在县内乃至周边区县医院中处于领先地位，为疑难病症的诊疗提供了强大支持。一些先进的医疗技术逐渐开展起来，如冠状动脉造影及支架内置术等。目前，在部分新技术中，不少项目处于县内乃至周边区县医院领先地位。2010年，县中医强院提出创建三级综合性中医院目标任务。2013年12月通过国家中医药管理局中医医院评审专家组验收，我院成功创建为国家三级甲等中医医院。