广东治疗扁平疣比较好的三甲医院有1、南方医科大学南方医院，2、南方医科大学珠江医院，3、南方医科大学第三附属医院，4、中山大学附属第三医院，5、广东省中医院等，扁平疣属于皮肤科，南方医科大学南方医院皮肤科疾病医疗设施齐全，在皮肤科疾病治疗方面有着丰富的经验；南方医科大学珠江医院皮肤科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名南方医科大学南方医院皮肤科
南方医科大学南方医院是一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院,全国百佳医院。医院设置诊疗科目111个,拥有临床医学一级学科博士学位授权点和临床医学博士后流动站;内科学(消化系病)为国家重点学科,外科学(骨外)为国家重点培育学科;拥有国家临床重点专科建设项目14个,国家中医重点学科4个;设有器官衰竭防治省部共建国家重点实验室、慢性肾病国家临床医学研究中心,国家高等院校学科创新引智基地1个,广东省肾脏病研究所、南方消化病研究所、广东省肝脏疾病研究所。广东省临床重点专科达31个,临床医学获评广东省攀峰重点学科,口腔临床医学获评广东省优势重点学科。
第二名南方医科大学珠江医院皮肤科
珠江医院是南方医科大学（原第一军医大学）第二附属医院、第二临床医学院，创建于1947年，编设65个专业科室、35个教研室，拥有国家临床医学一级学科博士学位授权学科、博士后科研流动站，国家级、省级临床重点专科23个、国家重点培育学科1个、国家中医药管理局重点学科1个、国家级培训基地10个、广东省医疗质量控制中心2个。
第三名南方医科大学第三附属医院皮肤科
南方医科大学第三附属医院始建于1953年，是一所集医疗、教学、科研为一体的综合性三级医院，为广东省骨科研究院，编设临床、医技科室共39个，教研室4个，展开床位1000张。拥有博士授权学科4个，硕士授权学科15个。目前已形成以骨科为龙头，妇儿生殖学科群、危急重症医学学科群、泌尿系疾病学科群、神经医学学科群等4个优势学科群的发展格局，其中骨外科是国家重点培育学科及高等院校重点学科、南方医科大学骨科研究所牵头单位，珠江学者设置岗位和国家临床重点专科带头人所在单位，设有8个亚专科，展开床位220张。
第四名中山大学附属第三医院皮肤科
中山大学附属第三医院(原中山医科大学附属第三医院),始建于1971年,是一所承担预防保健、医疗、康复以及医学教育和科研任务的大型综合性医院,是卫生部三级甲等医院和国家爱婴医院、广东省文明医院。医院学科门类齐全、专科特色明显。普外科、内分泌科、神经科、肾内科、耳鼻咽喉科属于国家级重点学科;肝移植科、感染性疾病科属于广东省医学重点专科;肝脏病学科是医院的龙头学科,目前已形成涵盖肝脏内科、肝脏外科、器官移植、重症监护、肝脏影像与介入治疗等多学科综合诊疗和临床科研的强势学科群;风湿内科、骨外科、泌尿外科、介入血管科、精神科、康复科等优势学科,不但在广东省、华南地区享有盛誉,在全国均有一定影响。
第五名广东省中医院皮肤科
广东省中医院(广州中医药大学第二附属医院、广州中医药大学第二临床医学院)始建于1933年,是我国近代史上最早的中医医院之一,被誉为“南粤杏林第一家”。　广东省中医院形成了一百多个特色鲜明、疗效明显的专科专病,其中脑病专科、心血管病专科、皮肤病专科、肾病专科、乳腺病专科、妇科病专科、脊柱专科、中医急症、颈椎病(脊柱)专科、骨病骨肿瘤专科、骨关节病专科、消化病专科、呼吸病专科、肿瘤病专科、耳鼻喉病专科、中医外科、针灸科、糖尿病专科、肝病专科、冠心病专科等是国家级和省级的重点专科,在国内和省内处于领先地位。 [收起]