广西治疗小袋纤毛虫病比较好的医院有1、广西医科大学第一附属医院，2、南宁市第四人民医院，3、广西龙潭医院(广西胸科医院)，4、广西桂东人民医院，5、钦州市第一人民医院等，小袋纤毛虫病属于传染科，广西医科大学第一附属医院传染科疾病医疗设施齐全，在传染科疾病治疗方面有着丰富的经验；南宁市第四人民医院传染科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名广西医科大学第一附属医院传染科
广西医科大学第一附属医院创建于1934年，是三级甲等综合医院，医院有临床科室46个，病区69个，医技科室19个，床位2750张。年门急诊服务患者267万人次，年手术5.2万台次，年出院患者12万人次。同时与广西各级医院建立“联盟、技术合作”：紧密型医联体（1家）、对口支援医院（3家）、技术协作医院（85家）、社区卫生服务中心（22家），推行双向转诊、分级诊疗制度。
第二名南宁市第四人民医院传染科
南宁市第四人民医院是广西规模最大的一所国家三级乙等传染病专科医院，以治疗艾滋病、结核病、肝病为主，设艾滋病科（2个病区）、结核病科（4个病区）、传染科肝炎病区（2个病区）、外科、内科儿科、妇产科、麻醉科、重症医学科等12个临床科室，设社区卫生服务中心1个，社区卫生服务站1个。设有检验科、放射科、药剂科、功能检查科、血液净化科等13个医技科室。
第三名广西龙潭医院(广西胸科医院)传染科
医院(广西胸科医院)位于柳州市大龙潭风景区旁，创建于1951年，是一所规模较大、技术力量雄厚、设备齐全，集医疗、预防、教学、科研于一体的“三级乙等”专科医院、自治区结核病归口治疗医...
第四名广西桂东人民医院传染科
我院是一所集医疗、科研、教学、预防、保健为一体的三级综合医院，医院心血管内外科、肝科、肾内科、泌尿外科、神经内外科、肿瘤科、核医学、呼吸科、消化内科等学科在桂东南地区铸就了颇具特色的专科品牌。
第五名钦州市第一人民医院传染科
钦州市第一人民医院创建于1965年，是综合实力雄厚的现代化国家三级甲等综合医院，设有55个临床、医技、门诊科室，病床1355张，年门诊量106万人次，年住院量5万人次，拥有1.5T超导磁共振、PRIMUS放疗直线加速器、全数字化通用型平板血管造影系统、64层螺旋CT、SPECT/CT机、四维动态B超等尖端设备700多台(件)，医疗设备价值近两亿元。建院以来，我院通过鉴定达到国际先进、国内领先水平的科研项目达到13项，国内先进、区内领先水平的46项，荣获国、省、厅、市级科研奖69项次，连年领衔钦州市科研主角。 [收起]