新疆治疗男科排名靠前的三甲医院有1、乌鲁木齐市中医医院，2、新疆自治区人民医院，3、昌吉州人民医院，4、喀什地区第一人民医院，5、新疆生产建设兵团第六师医院等，新疆男科医院排名是根据复旦医院排名、卫健委、患者口碑等要素综合产生，其中。
第一名乌鲁木齐市中医医院男科
乌鲁木齐市中医医院成立于1960年，医院糖尿病专科是全国重点专科，心脑血管病专科、肛肠病专科是自治区级重点专科，同时开展了中医药对老年性疾病、精神病疾病、亚健康状态、养生康复的临床研究和治疗。
第二名新疆自治区人民医院男科
新疆维吾尔自治区人民医院始建于1934年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健和社区卫生服务为一体的大型综合性“三级甲等医院”。曾先后荣获“全国文明单位”、“全国百佳医院”、“全国五·一劳动奖状”、“全国卫生系统先进集体”、“全国万名医师支援农村卫生工程先进集体”、“全国十大百姓放心医院”、“全国卫生系统思想政治工作先进集体”、“自治区民族团结进步模范单位”等荣誉称号，是中国医院竞争力·顶级医院100强。
第三名昌吉州人民医院男科
新疆昌吉州人民医院建于1955年，现已成为昌吉地区规模最大的一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的三级甲等综合医院。医院不仅是新疆医科大学、石河子大学医学院及昌吉卫生学校的教学医院，还是自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、兰州军区乌鲁木齐总医院、福建医科大学各附属医院的技术协作医院，是昌吉州120紧急救援中心和昌吉州传染病院所在地。近年来，医院年门诊量46万人次，年收治住院病人3.4万人，为保障和增进昌吉州各族人民的健康做出了积极贡献。
第四名喀什地区第一人民医院男科
喀什地区第一人民医院成立于1934年，是南疆最早的三级甲等综合医，现有编制床位1400张，平均开放床位2000张以上，现有在岗职工3449人，有PET-CT等多种现代化先进医疗检查设备，总价值近四亿元，可满足患者各类检查需求。目前，喀什地区第一人民医院综合实力在全疆综合医院中排名第三，地州医院中排名第一，是南疆区域医疗中心，承担着喀什地区、农改第农牧团场及克州、和田、阿克苏等地州毗邻县乡600多万人的医疗保健服务，服务半径400多公里。今后，医院将按照“办精品三甲医院，创疆内一流名院，建中亚医疗中心”的发展愿景，努力实现“双百”发展目标，把医院建成“丝绸之路经济带国际医疗中心”。
第五名新疆生产建设兵团第六师医院男科
新疆五家渠市人民医院现已更名为新疆生产建设兵团第六师医院。六师医院位于乌鲁木齐市北郊32公里，昌吉市28公里处的新城五家渠市，交通便利。1953年建院，是六师五家渠市规模最大，学科较全，技术力量雄厚，设备先进，诊疗条件优良，集医疗、教学、科研、预防保健、康复、急救为一体的综合性三级甲等医院、爱婴医院。医院现已成功开展了心脏及外周血管的介入诊断和治疗，永久性心脏起搏器安装，髋（膝）关节置换术，多种肿瘤根治手术，恶性肿瘤的介入治疗；开展了腹腔镜、胸腔镜、宫腔镜、关节镜等微创手术，普外、妇科成功开展了 [收起]