江苏南京治疗卵巢甲状腺肿比较好的三甲医院有1、江苏省中医院，2、南京市中医院，3、南京鼓楼医院，4、南京市妇幼保健院，5、中国人民解放军东部战区空军医院（原解放军四五四医院）等，卵巢甲状腺肿属于内分泌科，江苏省中医院内分泌科疾病医疗设施齐全，在内分泌科疾病治疗方面有着丰富的经验；南京市中医院内分泌科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名江苏省中医院内分泌科
江苏省中医院（南京中医药大学附属医院）创建于1954年10月，为全国首批成立的省级中医医院之一，医院共有5名专家入选，4位专家入选2017年首届全国百名名中医，4位专家荣膺国家岐黄学者，成为国内拥有最多国医大师、最多全国名中医的医院。另有25名全国中医师承指导老师、国家级名医传承工作室专家，白求恩奖章获得者2名，中国医师奖获得者2名，享受政府特殊津贴专家37名，有省级名中医、名中西医结合专家60名，江苏省首批国医名师6名。
第二名南京市中医院内分泌科
南京市中医院成立于1956年，是一所中医特色明显、中西医结合、集医疗服务功能和急救能力为一体的三级甲等中医院。设有临床及医技科室38个，其中国家级重点学科：中医肛肠病学，国家级重点专科7个；江苏省重点学科：中医脑病学，江苏省重点专科8个，南京市中医重点专科14个。
第三名南京鼓楼医院内分泌科
南京鼓楼医院，又名南京大学医学院附属鼓楼医院，是集医教研为一体的大型综合性三级甲等医院，拥有国家重点学科、国家临床重点专科9个，省临床医学中心4个、省医学重点学科8个、省级临床重点专科29个，省级质控中心5个，省专科、专病诊疗中心8个、市重点专科30个，博士点23个，硕士点32个。
第四名南京市妇幼保健院内分泌科
南京市妇幼保健院创建于1936年，为南京医科大学附属妇产医院、国家级爱婴医院、省内首家三级甲等妇幼保健院，医院学科体系完善，其中腔镜科为卫生部四级妇科内镜手术培训基地，中医科为全国综合医院中医药工作示范单位，产科、产前诊断研究室、新生儿科、妇科、麻醉科、中医科为省级临床重点专科，儿童保健科、妇女保健科、乳腺科、检验科、超声诊断科为市级临床重点专科，妇女保健科、儿童保健科、生殖医学、计划生育、乳腺病学为第二周期省妇幼保健重点学科。
第五名中国人民解放军东部战区空军医院（原解放军四五四医院）内分泌科
东部战区空军医院始建于1951年，是南京首批综合性三级甲等医院，是南京市城镇职工医保、居民医保定点医院，南京市急救站分站，南京市劳动能力鉴定检查定点医院，省、市“三信三优”单位，省新农合省级联网医院，全军第二批宇航员遴选体检定点医院，全军交通医学研究所南京临床基地，安徽医科大学临床医院，第二、第四军医大学、江苏大学医学院、皖南医学院、蚌埠医学院、吉林医药学院教学医院医院率先导入国际先进的质量管理体... [收起]