全国治疗胸内甲状腺肿比较好的三甲医院有1、北京协和医院，2、北京世纪坛医院，3、中日友好医院，4、首都医科大学宣武医院，5、解放军总医院第五医学中心等，胸内甲状腺肿属于内分泌科，北京协和医院内分泌科疾病医疗设施齐全，在内分泌科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京世纪坛医院内分泌科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京协和医院内分泌科
北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担高干保健和外宾医疗任务的医院之一，也是高等医学教育和住院医师规范化培训国家级示范基地，临床医学研究和技术创新的国家级核心基地。以学科齐全、技术力量雄厚、特色专科突出、多学科综合优势强大享誉海内外。在复旦大学医院管理研究所公布的“中国医院排行榜”中连续十年名列榜首。
第二名北京世纪坛医院内分泌科
首都医科大学附属北京世纪坛医院（北京铁路总医院），毗邻北京中华世纪坛，原为铁道部北京铁路总医院，创建于1915年，1989年通过全国首批三级甲等医院评审，为北京市属综合医院，是首都医科大学附属医院、首都医科大学肿瘤医学院、北京大学第九临床医学院、北京市中西医结合肿瘤研究所及北京世纪坛医院医联体理事单位。
第三名中日友好医院内分泌科
中日医院现编制床位1610张（含北区、西区），集医疗、教学、科研和预防保健等多项功能为一体，并承担中央保健医疗任务、国家卫生应急救援队任务，附设中日友好临床医学研究所，同时还是世界卫生组织戒烟与呼吸疾病预防合作中心、国家卫生计生委远程医疗管理与培训中心。
第四名首都医科大学宣武医院内分泌科
首都医科大学宣武医院创建于1958年，是一所以神经科学和老年医学的临床与研究为重点，以治疗心脑血管疾患为特色，承担医疗、教育、科研、预防、保健和康复任务的大型三级甲等综合医院。是新中国神经科学的初创基地和培育神经科学人才的摇篮之一,在国内有着重要学术地位。受国家卫生部委托，医院承办全国神经内科医师进修班、神经外科医师进修班、神经放射医师进修班，是国家级继续医学教育培训基地。
第五名解放军总医院第五医学中心内分泌科
　　解放军302医院前身是解放战争时期的“中共中央直属机关医院”,1954年7月正式命名为“中国人民解放军第三〇二医院”。医院在肝炎、肝硬化、肝癌、肝衰竭、肝移植、艾滋病、各种感染性腹泻和中枢神经系统感染等疑难病症的诊治及研究方面处于国内领先水平。拥有亚洲首台第四代射波刀、MRI,CT、流式细胞仪、激光共聚焦显微镜、全自动酶联免疫分析系统、正负压切换式病理解剖室等先进的设施设备,总价值近4亿元。 [收起]