北京治疗阴道内胚窦瘤比较好的三甲医院有1、北京协和医院，2、中国医学科学院肿瘤医院，3、北京市昌平区中医医院，4、中国中医科学院广安门医院，5、北京世纪坛医院等，阴道内胚窦瘤属于肿瘤科，北京协和医院肿瘤科疾病医疗设施齐全，在肿瘤科疾病治疗方面有着丰富的经验；中国医学科学院肿瘤医院肿瘤科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京协和医院肿瘤科
北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担高干保健和外宾医疗任务的医院之一，也是高等医学教育和住院医师规范化培训国家级示范基地，临床医学研究和技术创新的国家级核心基地。以学科齐全、技术力量雄厚、特色专科突出、多学科综合优势强大享誉海内外。在复旦大学医院管理研究所公布的“中国医院排行榜”中连续十年名列榜首。
第二名中国医学科学院肿瘤医院肿瘤科
中国医学科学院肿瘤医院，始建于1958年，原名日坛医院。1963年增设肿瘤研究所，此后又相继建立了河南林州、江苏启东等肿瘤高发防治现场。1983年迁至北京市东南龙潭湖畔，更名为中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所，1996年通过三级甲等医院评审。中国医学科学院肿瘤医院是建国以来第一家肿瘤专科医院、亚洲地区最大的肿瘤防治研究中心，是国家临床医学研究中心、国家肿瘤规范化诊治质控中心、国家食品药品监督管理局认证的国家药物临床研究基地，是集医教研防于一体，全方位开展肿瘤相关基础研究和临床诊治的国家标志性肿瘤专科医院。
第三名北京市昌平区中医医院肿瘤科
昌平区中医医院始建于1984年，1992年12月正式建院。医院现有职工935人，其中高级职称90人，专业技术人员占职工总数的86％，拥有固定资产1.41亿元。设有临床科室22个，病区11个，国家级中医重点专科2个，市级重点中医2个，院级重点专科2个，中医传统科室4个，“薪火传承”老中医工作室1个，医技科室10个，药剂科室10个专业组，分院2个，南院院区1个。开设床位402张。
第四名中国中医科学院广安门医院肿瘤科
中国中医科学院广安门医院(暨中国中医科学院第二临床医药研究所)始建于1955年，是国家中医药管理局直属的集医疗、教学、科研和预防保健为一体的三级甲等中医医院，医院设有风湿病科、内分泌科、心血管科、肾内科、呼吸科、脾胃病科、外科、妇科、儿科、肛肠科、肿瘤科、眼科、骨科、皮肤性病科、泌尿男科、针灸科、耳鼻喉科、心理科、心身医学科、口腔科、手术麻醉科、急诊科、感染疾病科、肝炎门诊、肠道门诊和艾滋病。
第五名北京世纪坛医院肿瘤科
首都医科大学附属北京世纪坛医院（北京铁路总医院），毗邻北京中华世纪坛，原为铁道部北京铁路总医院，创建于1915年，1989年通过全国首批三级甲等医院评审，为北京市属综合医院，是首都医科大学附属医院、首都医科大学肿瘤医学院、北京大学第九临床医学院、北京市中西医结合肿瘤研究所及北京世纪坛医院医联体理事单位。 [收起]