全国治疗房间隔缺损比较好的三甲医院有1、中日友好医院，2、空军总医院，3、北京大学第一医院，4、茂名市中医院，5、广东省人民医院等，房间隔缺损属于儿科，中日友好医院儿科疾病医疗设施齐全，在儿科疾病治疗方面有着丰富的经验；空军总医院儿科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名中日友好医院儿科
中日医院现编制床位1610张（含北区、西区），集医疗、教学、科研和预防保健等多项功能为一体，并承担中央保健医疗任务、国家卫生应急救援队任务，附设中日友好临床医学研究所，同时还是世界卫生组织戒烟与呼吸疾病预防合作中心、国家卫生计生委远程医疗管理与培训中心。
第二名空军总医院儿科
中国人民解放军空军总医院位于北京市海淀区阜成路西钓鱼台，东侧毗邻高耸入云的中央电视发射塔和碧波荡漾的玉渊潭公园，西南侧环绕着清澈蜿蜒的昆玉河。总占地面积15万平方米，总建筑面积约30万平方米。医院始建于1950年5月，1956年10月25日正式开院，是新中国军事航空医学的发源地。主要承担空军飞行人员航空病、常见病诊疗防治研究及医学鉴定任务；承担预备航天员的体检选拔任务；承担空军部队及联勤部队官兵的健康保障和疾病救治；还面向人民群众提供优质医疗服务。已发展成为一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型现代化综合性三级甲等医院。
第三名北京大学第一医院儿科
北京大学第一医院(北大医院)位于北京老皇城内，是距离中南海最近的医院，是一所融医疗、教学、科研、预防为一体的大型综合性三级甲等医院。拥有着一批国内的首创专业学科以及在我国率先开展的诊疗技术，如国内首创小儿科(1940)、泌尿外科、肾脏病专业、综合医院心血管病房、小儿神经专业等。
第四名茂名市中医院儿科
广东省茂名市中医院创建于1976年，是一所以中医中药为主、中西医结合，集医疗、教学、科研、保健、康复于一体的综合性现代化三级甲等中医院，设有28个临床科室，52个专科门诊，3个门诊部、2间分院和1间附属医院；其中妇产科为国家级重点专科；骨科、妇科和脑病科为广东省“十一五”重点专科；心血管内科、肿瘤科和针灸科为广东省“十二五”重点专科。
第五名广东省人民医院儿科
广东省人民医院（广东省医学科学院）创建于1946年，下辖2个分院、6个门诊部和6个研究所，托管2家基层医院， 医院各专科亚专科设置齐全，共有12个国家临床重点专科、34个广东省临床医学重点专科/学科。我院2017年度全国最佳医院排行榜（复旦版）综合排名第29名，位居全国省级人民医院前列；排名进入全国前十的专科共5个：心外科（全国第3名）、心血管病（全国第4名）、老年医学（全国第6名）、急诊医学（全国第6名）、放射科（全国第9名）；专科提名获全国前十的有胸外科、风湿科、肿瘤学和康复医学。 [收起]