北京朝阳治疗单纯性肾囊肿比较好的医院有1、中日友好医院，2、首都医科大学附属北京朝阳医院，3、中国医学科学院肿瘤医院，4、首都医科大学附属北京安贞医院，5、北京二龙路医院等，单纯性肾囊肿属于外科，中日友好医院外科疾病医疗设施齐全，在外科疾病治疗方面有着丰富的经验；首都医科大学附属北京朝阳医院外科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名中日友好医院外科
中日医院现编制床位1610张（含北区、西区），集医疗、教学、科研和预防保健等多项功能为一体，并承担中央保健医疗任务、国家卫生应急救援队任务，附设中日友好临床医学研究所，同时还是世界卫生组织戒烟与呼吸疾病预防合作中心、国家卫生计生委远程医疗管理与培训中心。
第二名首都医科大学附属北京朝阳医院外科
首都医科大学附属北京朝阳医院建院于1958年2月24日，是北京市医院管理局直属，集医疗、教学、科研、预防为一体的三级甲等医院，是首都医科大学第三临床医学院，也是北京市医疗保险A类定点医疗机构。医院拥有先进的大型医用设备，包括1.5T和3.0T核磁共振成像系统、PET-CT、256排断层螺旋CT、全自动生化流水线、全数字直线加速器、数字减影血管造影X线机、数字化彩色超声波诊断仪、平板数字胃肠造影机等国际一流的医疗设备。拥有国际一流检验检测设备50余台，可开展临床检验项目近400项，并具有亲子鉴定等社会委托检测的资质。
第三名中国医学科学院肿瘤医院外科
中国医学科学院肿瘤医院，始建于1958年，原名日坛医院。1963年增设肿瘤研究所，此后又相继建立了河南林州、江苏启东等肿瘤高发防治现场。1983年迁至北京市东南龙潭湖畔，更名为中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所，1996年通过三级甲等医院评审。中国医学科学院肿瘤医院是建国以来第一家肿瘤专科医院、亚洲地区最大的肿瘤防治研究中心，是国家临床医学研究中心、国家肿瘤规范化诊治质控中心、国家食品药品监督管理局认证的国家药物临床研究基地，是集医教研防于一体，全方位开展肿瘤相关基础研究和临床诊治的国家标志性肿瘤专科医院。
第四名首都医科大学附属北京安贞医院外科
首都医科大学附属北京安贞医院集医疗、教学、科研、预防、国际交流五位一体，是以治疗心肺血管疾病为重点的三级甲等综合性医院，在全国心血管领域处于领军地位。近年来，坚持“强专科，大综合”的办院理念，专科特色突出，多学科综合实力强劲，在国内外享有盛誉。
第五名北京二龙路医院外科
北京市肛肠医院(北京市二龙路医院)创立于1937年，是一所以治疗肛肠疾病为特色，融医疗、教学、科研、预防为一体的医保定点二级甲等医院。2012年成立了“北京市肛肠疾病研究院”。医院设有肛肠外科、内科、外科、妇科、中医科、口腔科、眼科、五官科、骨科、针灸科、皮科等27个临床科室11个医技科室，下设德胜社区卫生服务中心及七个社区卫生服务站。2012年7月在西城区德外大街16号高科技园区内北院区投入使用，床位总量达到400张，医院建筑总面积3.9万平方米。 [收起]