北京治疗直肠阴道瘘比较好的医院有1、北京协和医院，2、北京301医院，3、北京大学人民医院，4、北京大学第一医院，5、首都医科大学附属北京儿童医院等，直肠阴道瘘属于外科，北京协和医院外科疾病医疗设施齐全，在外科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京301医院外科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京协和医院外科
北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担高干保健和外宾医疗任务的医院之一，也是高等医学教育和住院医师规范化培训国家级示范基地，临床医学研究和技术创新的国家级核心基地。以学科齐全、技术力量雄厚、特色专科突出、多学科综合优势强大享誉海内外。在复旦大学医院管理研究所公布的“中国医院排行榜”中连续十年名列榜首。
第二名北京301医院外科
中国人民解放军总医院（301医院）创建于1953年，是集医疗、保健、教学、科研于一体的大型现代化综合性医院。设置165个临床、医技科室，233个护理单元，拥有8个国家重点学科、1个国家重点实验室、20个省部级及全军重点实验室、33个全军医学专科中心和研究所，形成了以综合诊疗为特色的13项专业优势。
第三名北京大学人民医院外科
北京大学人民医院以建设医、教、研、管理与国际接轨的大学医院为战略目标，着力建设全国疑难急重症诊疗中心，临床医学教育创新示范基地，临床医学科学研发基地， 医院、医疗卫生体制改革探索、实验、示范基地。现已发展成为集医疗、教学、科研为一体的现代化综合性大学医院。医院正式员工总数2379人，中国工程院院士1名，编制床位1448张(开放床位1700余张)，设有40个临床科室、17个医技科室和25个职能处室。在学科建设方面，医院搭建支持平台、关注重点学科发展，形成了以11个国家教育部重点学科为龙头，以18个卫生部临床重点专科、5个北京大学级研究所、3个北京市重点学科、1个国家中医药管理局中医药重点学科以及国家级人才培养模式示范区、国家级特色专业示范点、国家级教学创新团队为战略支点，临床、教学、科研三大学科集群比肩并行的学科发展布局。
第四名北京大学第一医院外科
北京大学第一医院(北大医院)位于北京老皇城内，是距离中南海最近的医院，是一所融医疗、教学、科研、预防为一体的大型综合性三级甲等医院。拥有着一批国内的首创专业学科以及在我国率先开展的诊疗技术，如国内首创小儿科(1940)、泌尿外科、肾脏病专业、综合医院心血管病房、小儿神经专业等。
第五名首都医科大学附属北京儿童医院外科
首都医科大学附属北京儿童医院是集医疗、科研、教学、保健于一体的三级甲等综合性儿科医院，前身是我国现代儿科医学奠基人诸福棠院士于1942年创办的北平私立儿童医院。医院总占地面积7万平方米，建筑面积12万平方米，编制病床970张，年门诊量300余万人次，住院病人7万余人次，手术逾2.3万例。2017年，医院被国家卫生健康委(原国家卫生计生委)批准成为国家儿童医学中心，2019年被批准设立国家儿童肿瘤监测中心，为儿童血液病、恶性肿瘤防控提供大数据支撑。 [收起]