江西治疗口腔毛滴虫病比较好的三甲医院有1、江西省胸科医院，2、南昌市第一医院，3、南昌大学第四附属医院，4、江西省儿童医院，5、江西省口腔医院等，口腔毛滴虫病属于口腔科，江西省胸科医院口腔科疾病医疗设施齐全，在口腔科疾病治疗方面有着丰富的经验；南昌市第一医院口腔科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名江西省胸科医院口腔科
江西省胸科医院是江西省唯一获得该资质的三级甲等医院。胸外科、呼吸内镜介入科、结核内科是江西省医学领先学科，肿瘤学科是江西省医学领先建设学科。呼吸科、心血管科、神经危重症学科是医院重点建设学科。胸腔镜微创外科手术、气管支气管镜微创介入手术达国内先进水平，难治性肺结核及耐多药肺结核病人的治疗技术处于省内领先水平。医院内镜中心2008年被卫生部授予“国家卫生部呼吸内镜培训基地”。
第二名南昌市第一医院口腔科
南昌大学第三附属医院（南昌市第一医院）是一所集医疗、教学、科研、预防保健于一体的南昌市市属最大的综合性三级甲等医院，是江西省最早的4所三级甲等医院之一。
第三名南昌大学第四附属医院口腔科
南昌大学第四附属医院是一所融医疗、教学、科研、预防保健和社区卫生服务为一体的省直三级甲等综合性医院。设有呼吸与危重症医学科、神经内科、消化内科、内分泌科、肿瘤内科、普外科、泌尿外科、骨科、脑瘫外科、重症医学科、妇产科、儿科等35个临床科室，15个医技科室，诊断治疗水平均达到省内先进水平。现有国家级临床药师培训基地1个，江西省药事管理质量控制中心1个，江西省住院医师规范化培训基地专业16个。消化内科为江西省临床重点专科;脑瘫外科为国家民政部残疾孤儿手术康复明天计划全国定点(中南部地区唯一);康复医学科为全国脑瘫针刀微创治疗与康复示范基地。
第四名江西省儿童医院口腔科
江西省儿童医院创建于1955年6月1日，是一所集医疗、科研、教学、保健职能为一体的全国首批三级甲等、省级综合性儿童医院，是我省儿科医学人才培养、教学基地。医院设有临床科室31个、医技科室10个，其中国家临床重点建设专科1个，省级医学领先学科9个，省级医学领先专业建设学科2个，省级儿科中心2个。
第五名江西省口腔医院口腔科
南昌大学附属口腔医院实行南昌大学口腔医学院、南昌大学附属口腔医院、江西省口腔医院、江西省口腔病研究所四位一体的管理体制，是集医疗、教学、科研、预防、保健、培训为一体的三级甲等口腔专科医院。前身系创建于1980年的江西医学院口腔医学系，2003年增名“江西省口腔医院”，2005年由江西医学院附属口腔医院更名为南昌大学附属口腔医院。 [收起]