安徽治疗基质性角膜炎比较好的三甲医院有1、安徽省立儿童医院，2、合肥市第一人民医院，3、合肥市第二人民医院，4、合肥市妇幼保健院，5、芜湖市第二人民医院等，基质性角膜炎属于眼科，安徽省立儿童医院眼科疾病医疗设施齐全，在眼科疾病治疗方面有着丰富的经验；合肥市第一人民医院眼科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名安徽省立儿童医院眼科
安徽省儿童医院为全省一所设备先进、学科门类齐全，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的省级大型综合性三级甲等儿童专科医院。医院现为安徽省儿童医疗协会会长单位、安徽省儿科专业质控中心主任单位、安徽省新生儿急救中心和随访干预中心、安徽省儿童急救中心、北京儿童医院集团首批成员单位、长三角地区儿童医疗联盟共同发起单位；是安徽省儿科医学研究所所在单位、安徽医科大学附属省儿童医院、第十批省级博士后科研工作站（博士后创新实践基地）、国家级儿科住院医师规范化培训基地、国家级新生儿围产期医学专业专科医师培训基地；还是全省儿科重症监护专科护士培训基地、全省妇幼医护培训基地、新生儿内科培训基地、省手术室专科护士临床实践基地、省骨科专科护士临床实践基地、省肿瘤专科护士临床实践基地等。
第二名合肥市第一人民医院眼科
合肥市第一人民医院于1954年开诊，是一所集医疗、教学、科研、保健、预防、康复、急救、健康检查、临终关怀为一体的大型三级甲等综合性医院。2004年率先成立全省首家国有医疗集团，2006年经安徽省政府批准成为安徽医科大学第三附属医院。
第三名合肥市第二人民医院眼科
合肥市第二人民医院总占地面积200余亩，含三个院区，下辖2个社区卫生服务中心及瑶海区13家紧密型医联体单位。获批合肥市“十三五”规划医养结合老年护理院项目，规划床位1000张。目前，拥有床位3016张，开放床位2537张，职工2517人，卫生技术人员2200人，高级职称203人，研究生导师65人，教授、副教授107人，博士及在职博士45人，研究生培养点28个。医院拥有临床学科30个、医技学科11个，其中，安徽省重点学科2个、合肥市重点学科17个、安医大重点学科1个、GCP专业12个、市质控中心19个、市医学分会25个。
第四名合肥市妇幼保健院眼科
安徽省妇幼保健院始建于1951年，是一所集医疗、教学、科研、保健于一体的三级甲等专科医院，担负着安徽省内妇科疾病诊治、高危妊娠处理、助产分娩、辅助生育、计划生育手术、妇幼保健、新生儿疾病治疗、乳腺病诊治等医疗保健的重要任务。目前医院拥有本部、东区（合肥市儿童医院）、西区（国际妇女儿童医学中心）、南区(滨湖院区)、临泉分院五个院区，五个院区总建筑面积35万平方米，各院区建成后我院将成为体量位居全国前列的妇幼保健院。现有在岗职工1300多名，目前实际开放床位1450张。
第五名芜湖市第二人民医院眼科
芜湖市第二人民医院始建于1953年，是芜湖市人民政府创办的第一所综合性医院。历经六十年，已发展成为一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的三级甲等综合性医院，是皖南医学院附属医院和硕士生培养点，南通大学芜湖临床学院，武汉大学第一临床学院硕士生培养点，复旦大学附属中山医院协作医院，复旦大学附属肿瘤医院友好合作医院,中国医科大学附属盛京医院“盛京医疗联盟”医院，法国第戎医疗中心协作医院。 [收起]