儿科是余杭区规模最大的儿科临床医疗、教学和科研中心，它承担了全区以及海宁、德清、桐乡等周边县市部分地区的儿童医疗保健任务。

儿科现有医护人员41名，其中高级职称5名。对小儿常见病、疑难病、传染病和新生儿疾病的诊治有丰富的临床经验，并以综合医院先进完善的医疗仪器设备及ICU、血液透析室作后盾，对小儿危重病人有较高水平的综合抢救能力。

除儿科急诊24小时开放外，儿科门诊也实行了错时上班工作制，每天中午、每周六、日及各种节假日均开放门诊，还开设了每周三、四、五上午儿童哮喘专科专家门诊，每周一、六上午儿童生长发育专科专家门诊，每周二下午新生儿专科门诊。其中每周三、六上午为省儿童医院专家门诊。尤其是哮喘专科门诊的开设，对儿童哮喘病人定期随访，指导患儿规范用药，使大多数哮喘患儿的病情得到了控制，减轻了哮喘病带来的长期困扰。该科还开展了雾化吸入、经皮给药等治疗项目，极大地满足了病人的需求。其中新技术“PARI BOY压缩雾化吸入在儿科喘息性呼吸道疾病中的应用”获余杭区科协“金桥工程”三等奖。近年来儿童矮小症、肥胖症及性早熟逐渐引起社会的关注，新开设的儿童生长发育偏倚特色专科门诊为许多家庭排忧解难，对此专科的研究有一定的造诣。

新生儿病房和新生儿重症监护室，是全区重点学科，医院的特色科室之一。擅长诊治各种新生儿危重病和早产儿养育;与产科协作，对每日分娩之新生儿和高危产妇生产过程进行全程监护。配备进口呼吸机、CPAP辅助呼吸仪、监护仪、血氧饱和度检测仪、婴儿培育暖箱、辐射抢救台、蓝光治疗箱等先进仪器。每周二下午开设新生儿专科门诊，方便各位新生宝宝疾病诊治，喂养及护理咨询，高危儿的长期随访等。

近年来儿科完成科委、科协立项课题四项，在国家、省、市级杂志上发表论文30余篇，并获杭州市自然科学论文二等奖。