消化内科建于1971年,现为江苏省省级临床重点专科.南通医学院及南通医学院附属医学的重点科室。 消化内科下设有：一个独立的病区,病床数45张,每日设有专科门诊、消化内镜中心、消化B超室、消化病实验室。
　　消化内科病区：设在5号楼3楼,病床数为45张床位,为消化专科病区,为医院教学.科研提供了较好的条件。下设3组,每组配有主任医师.副主任医师(或主治医师).住院医师各1人,以及临床研究生.进修生1~2人。收治疾病范围：肝脏病.胃肠道疾病及胆.胰.腹膜疾病。消化专科门诊：星期一~星期五每日有主任医师1人及副主任医师各1人。星期六及星期日每日为主任医师或副主任医师1人。消化内镜中心：位于附院急诊大楼6楼,占地600多平方米,具有宽敞舒适的候诊大厅,设有护士站、胃镜室、肠镜室、内镜X线机室、腹腔镜室、胃肠动力检查室、多媒体演示室等。拥有目前国内最先进的日本Olympus电子胃镜.电子肠镜,纵轴彩色多普勒超声内镜以及德国ERBE氩气刀及电凝.电切装置.德国WOLF和日本Olympus腹腔镜等,常规开展胃镜.肠镜.腹腔镜.超声内镜检查及内镜下逆行胰胆管造影术等多项内镜检查,并开展多项内镜下治疗技术包括内镜下胃肠道止血、胃肠道息肉治疗、硬化剂治疗食道静脉曲张、食道狭窄扩张及置管、内镜下乳头括约肌切开、胰胆管网篮及气囊取石术、胰胆管外流及内置管等。
　　消化内镜中心最近新开展的技术有：1.纵轴超声内镜：纵轴超声内镜不同于传统的内镜超声,不仅对消化道及其周围的病变有极高的分辨力,而且针对这些病变还可以进行以诊断和治疗为目的的介入技术,为多种疑难疾病的诊断和治疗提供了崭新的方法。纵轴超声内镜可进行黏膜下肿瘤的诊断与鉴别,胃黏膜肥厚病与浸润性胃癌的鉴别.食管癌和胃癌的诊断和分期,胆总管.壶腹部病变及胰腺疾病的诊断,以及内镜超声引导下细针吸收细胞学检查及注射治疗等。2.氩离子束凝固术：氩离子束凝固术是一种新的电凝技术,这种装置通过氩气离子化后将能量传递至组织。消化内镜中心从2002年底引入内镜治疗,其使用方便,疗效明显且安全性好,优于微波,激光等技术。临床上可应用于Barrett食管、恶性肿瘤、息肉及腺瘤、消化道出血等治疗。
　　消化内科消化B超室：设在急诊大楼2楼B超室。业务范围：超声对肝.胆.胰疾病的诊断和治疗,包括彩色多普勒超声诊断肝.胆.胰疾病,腹部疾病超声引导下肝.胆穿刺术及胰腺穿刺术,经皮肝门静脉化学栓塞治疗肝癌及细针穿刺酒精治疗肝癌等。消化病实验室：服务于临床医疗的主要项目有：(1)肝脏病临床酶学及肝癌标志物对肝病的诊断应用,包括血清与同工酶对肝胆疾病的诊断,肝癌标志物(肝癌特异性GGT同工酶及肝癌特异性GPDA同工酶)对肝癌的诊断(2)肝纤维化标记物对肝纤维化的诊断(3)PCR检测技术(HBV?DNA.HCV?RNA等)。
　　消化内科完成历年本科生及专科生的诊断学(部分章节)及内科学(消化系统)的教学和临床实习生带教任务。自1979年起,消化内科为南通医学院硕士研究生点之一,有硕士授与权。每年招收培养硕士研究生3-8人(3年制),到目前为止,已培养出硕士研究生45人, ?读研究生23人。
　　消化内科已完成国家自然科学基金课题2个及省课题7个,已获得部.省.市级科研成果奖32项。其中自1997年以来,获科技成果奖8个(其中省级科技成果三等奖3项),消化内科发表论文共计320多篇(其中发表于国外杂志及中华系列杂志计78篇),主编医学类专著11本,参加编写医学类专著26本。