南京医科大学第三附属医院儿科是扬州地区重点专科，现有医护人员24人，其中具有高技术职称医师5人，病区床位32张。儿内有病床26张，新生儿病床6张。
　　儿科设有新生儿重症监护室。小儿高压氧舱室。儿科教研室。实验室。儿科具有新生儿。神经。呼吸。肾脏。血液。消化。内分泌7个专业组，拥有美国新生儿监护仪。记录仪。脉博血氧监护仪。无创血压监护仪。经皮胆红素测定仪。微量血糖测定仪。远红外抢救台。蓝光治疗仪。微电脑输液泵。英国小儿呼吸机。早产儿培养箱。国产先进小儿高压氧舱。CRP测定仪。电脑中频药物给药治疗仪等先进设备20台（套）。
　　儿科目前已开展了新生儿窒息复苏技术新生儿支气管肺灌洗术。气管插管下机械通气术。新生儿神经行为测定。儿童心理测试。脑瘫早期干预。新生儿黄疸及肝炎综合症治疗。呼吸专业开展项目：吸入疗法治疗婴幼儿哮喘。儿童哮喘。哮喘过敏原测定。末梢血支原体衣原体检查。末梢血C反应蛋白检查。药物中频理疗等一些在国内比较先进的检查方法及治疗手段，在本地区享有很高声誉。
　　儿科各专业组具有良好的人才梯队，具有治疗儿科各类疾病能力，在临床。医疗。教学。科研工作中取得了成就。儿科开展了三级医院部分诊疗项目，开展江苏省。南医大。扬州卫生局。仪化公司立项科研课题10余项，近5年在国家级和省市级医学刊物。学术会议发表论文综述。译文共20余篇，获多项科技成果奖，并圆满完成南医大等医学院校临床教学。实习带教任务。
　　儿科现有主任医师2名，副主任医师3名，主?医师6名，住院医师2名，主管护师9名，护师1名。
　　儿科专科特色：哮喘专科：常年有经验丰富的胡玲副主任医师和吴国栋主治医师坐诊，拥有先进的医疗仪器。对哮喘患儿进行疾病临床分级，并制定有效的治疗方案，采用点刺法确定过敏原，15分钟后观察效果，患儿无痛苦，为哮喘脱敏治疗提供了可靠的依据。每周一上午门诊。
　　儿科小儿神经专科：由临床经验丰富的高燕勤副院长。主任医师坐诊，对小儿癫痫病，儿童多动症，儿童抽动症，学习困难进行诊治，对小儿癫痫。脑瘫的诊断及治疗有独到特色。对新生儿颅内出血。缺氧缺血性脑病。新生儿高胆红素脑病患儿通过早期干预治疗，大大降低了后遗症，提高了生活质量。并进行婴幼儿期智能发育随访。每周三上午门诊。
　　儿科小儿肾脏病专科：由临床经验丰富的蒋木平主任医师坐诊，采用中西医结合。配合微量元素序贯治疗的方法，使一批来自湖南。安徽。山东等地常年不愈的难治性肾病患儿恢复了健康。每周四上午门诊。
　　儿科新生儿专科：由经验丰富的白燕萍副主任医师坐诊，在新生儿颅内出血。胎粪吸入性肺炎。呼吸衰竭。出血性坏死性小肠炎。肺透明膜病等治疗成功率达国内先进水平。每周五上午门诊。
　　儿科中医儿科：由经验丰富的郑仪宁主治医师坐诊，采取中西医结合的治疗方法，对儿科多种疾病治疗取得良好的效果。每周二。六上午门诊。