南京医科大学第三附属医院消化内科是集临床医疗。教学。科研。内镜诊断。介入治疗于一体的综合性病区，科室设置齐全，由消化科。内分泌科。血液科。肿瘤科等组成。现有医护人员19人，其中副教授2人，副主任医师4人，主治医师3人，讲师2人。
　　消化内科拥有日本pentax电子胃镜。电子肠镜。十二指肠镜。小儿胃镜。欧林帕斯纤维胃镜。纤维肠镜。14C检测仪。微电脑化疗泵。进口多功能全立量金标检测仪。丹纳胰岛素泵。多台强生血糖仪。CPR检测仪。热疗仪等先进设备。
　　消化内科目前已开展胃镜下胃黏膜折叠术治疗胃食管反流病，乳头肌切开取石治疗胆总管结石外科术后胆道残余结石，乳头肌切开治疗胆源性胰腺炎，食道扩张或置放支架治疗晚期或术后复发食道癌。贲门癌，无痛胃镜。肠镜，肿瘤皮下埋入式动脉置管和外周中心静脉置管微泵化疗，雾化加氧吸入化疗，B超或CT引导下肝穿刺活检和酒精注射治疗肝癌，各种肿瘤血管性介入性化疗。栓塞。快速糖基化血红蛋白。快速尿微量白蛋白检测，胰岛素检测，甲状腺功能检测。骨髓穿刺及活检。免疫组化。染色体检测诊断血液病等检查手段。
　　消化内科各专业组具有良好的人才梯队，在临床。医疗。教学。科研工作中取得了较好的成就，开展了三级医院部分诊疗项目及多项江苏省。南医大科研课题，在国家级和省级医学刊物发表医学论文20余篇，获多项科技成果奖。并圆满完成南医大等医学院校临床教学。科研。实习带教任务。