消化科始建于1961年，由我国著名的消化病专家杨英福教授创建，因在我国临床最先应用胃镜而闻名。消化科亦是原兰州医学院最早的硕士学位授予点。目前消化科下设有住院部病房、门诊、内镜室、胃肠功能室和实验室等功能单元，共有医生10名，其中主任医师、教授3名（2名为博士研究生），副主任医师、副教授1名，主治医师4名，住院医师2名。科室人员技术力量雄厚，结构合理。科室拥有先进的电子胃镜、结肠镜、胶囊内镜，多导胃肠功能仪，C-14呼气检测仪等诊断和治疗设备。在甘肃省对胃、十二指肠、小肠和结肠以及肝胆胰等脏器疾病的诊断和治疗方面处于先进水平，并开展了对消化道出血、息肉病、食管良恶性狭窄、肝硬化食管胃底静脉曲张内镜下治疗等工作。
　　消化科临床、科研、教学并重。科室现有甘肃省555人才和省卫生厅青年学术技术带头人各1名；并有两人分别担任省消化学会副主任委员和省消化内镜学会副主任委员。目前承担国家自然科学基金项目1项，省部级课题近10项。消化科成立以来培养硕士研究生40余人，现在读研究生近20名，并先后在国际SCI、中华系列等国家级杂志发表论文百余篇，先后获得甘肃省科技进步奖和医学奖等多项奖励。
　　多年以来，消化科全体医护人员本着“以人为本，全面提高医疗质量”的宗旨，团结协作、共同努力和踏实工作，使科室临床诊疗水平大幅度提升，医疗安全得到保证，科研、教学水平及实力上升，服务质量明显提高。