上海东方医院肿瘤医学部下设I期临床研究中心、肿瘤科（南北两院区）、肿瘤放射治疗科及其它肿瘤相关学科，是上海市医学重点专科、浦东新区高峰、高原学科、医院重点学科。目前拥有床位近200张，年诊治各类肿瘤患者达10万余人次，位居上海市三甲综合性医院同类学科前列。

肿瘤医学部由我国著名肿瘤学专家、中国临床肿瘤协会理事长李进教授领衔，学科致力于打造国内一流并具有国际视野的肿瘤多学科团队（MDT），在消化道肿瘤、头颈部肿瘤、淋巴瘤、肺癌、乳腺癌等诊治领域达到国内领先水平。同时在全国率先开展肿瘤相关科室合作，建立结直肠癌、胃癌、头颈部肿瘤等多学科诊疗团队和诊疗制度，对初治和疑难病例开展MDT门诊和讨论，根据患者具体情况，一人一策，综合应用手术、放疗、化疗、靶向治疗、免疫治疗、肿瘤微创介入治疗等手段，结合前沿肿瘤研究成果和治疗指南，规范制定多学科诊疗方案。

肿瘤科（北院）隶属于上海市东方医院肿瘤医学部，现有医师8名，其中教授1人，主任医师1人，副主任医师3人，主治医师1人，住院医师3人，博士生导师1人，硕士生导师3人。同济大学以及上海交通大学合作PI 2人，在读博士后2人，博士和硕士研究生各10余人。

肿瘤科（北院）在学科带头人、科主任董春燕教授带领下，以肿瘤和血液系统疾病患者的治疗随访的全程管理和全程指导以及个体化综合诊疗为特色，全面开展了化疗、放疗、内分泌治疗、靶向治疗、免疫治疗、血管介入和栓塞治疗、肺转移和肝转移放射性粒子植入治疗与射频消融治疗、输液港植入术、肿瘤穿刺活检、肿瘤高频热疗等各项诊疗策略及新技术。
拥有肿瘤疫苗产学研合作研发平台，纳米医工合作转化平台。承担国家、省部及浦东新区等各级课题近30项，荣获上海市科技进步三等奖、医学科技奖及上海市医树奖等多项表彰。