六院东院科设有生化室、微生物室、免疫室、基因扩增室、临检门诊检验室以及急诊检验室，检测项目达600余项。拥有较多当前先进的各种检测设备，如贝克曼AU5800系列生化仪、罗氏e601系列化学发光仪(检测肿瘤标志物、骨标志物、甲状腺激素等)、贝克曼特定蛋白分析仪Image800(检测免疫蛋白或代谢物等)、雅培i2000分析仪(检测乙肝、艾滋以及梅毒等抗原或抗体)、BD血培养鉴定仪(微生物培养鉴定)、强生干式生化仪(急诊)、ABI系列荧光定量PCR仪(核酸定量检测);另外，血常规、尿常规、血粘度、血沉及凝血等项目的检测仪器均为上海巿区三级甲等医院检验科的主流进口仪器，性能可靠稳定。检验科工作人员的组成，本科及以上学历达60%，其中博士和硕士学历占25%，检验队伍具有较高专业素养和业务能力。

科室实行电脑联网化管理，提高了报告准确率。面向门诊、急诊的部分检测项目，检验报告立等可取，为疾病诊断、治疗提供了迅速、准确和可靠的依据及资料。

质量是检验的生命，好的管理是保证质量的前提。近几年，六院检验科在上海巿区三级甲等医院质量评比中一直排名第一。东院检验科在质量管理上沿用总院的管理方式，以确保检验质量安全可靠。