上海交通大学附属第六人民医院耳鼻咽喉科是卫生部国家级临床重点专科，上海市重中之重临床重点专科，上海交通大学及第六人民医院重点专科，附设上海市听力测试中心、鼾症诊治中心、上海交通大学眩晕疾病诊治中心，牵头成立了上海交通大学医学院耳鼻咽喉科研究所、上海东方耳鼻咽喉科研究所，为上海交通大学博士、硕士学位研究生培养点、博士后流动站，苏州大学硕士学位研究生培养点。承担国家级继续教育项目5项。先后承担国家级课题10余项，省部级课题10余项，获得省市级科技进步奖10余项。

上海交通大学附属第六人民医院东院耳鼻咽喉科目前是东院重点学科，核定床位12张。科室拥有五名医师，其中正高两名，包括博士生导师一名;主治医师一名;住院医师两名。学历方面：博士一名，硕士三名。目前承办国家级继续教育项目一项;承担省部级课题、申康课题各一项。东院耳鼻咽喉科具备三级甲等医院耳鼻咽喉的各种先进技术，能正确诊断及治疗各种耳鼻咽喉头颈外科的常见病、多发病，尤以耳显微外科技术、鼾症诊疗技术及咽喉包括头颈各种良、恶性疾患的诊治为特色，将为浦东南汇临港及周边地域病人提供优质的医疗服务。