楚东医院常设的科室有：微创外科(胸外、普外、腹外、肝胆、胃肠、泌尿、骨科)、微创科、内镜科、内科、普通外科、产科、创伤科、疼痛科、口腔五官科、皮肤科、放射介入科、影象诊断科、检验科、病理科等。拥有医疗技术人员40余名,包含着高级职称6名,中级10名,初级20余名。

楚东医院已拥有一批先进、完善的医疗器械和设备,有影像诊断设备如800mA大型X光机、数字胃肠机、1000mA大型C臂机、MRI、三维彩色B型超声多普勒、日本Aloka B超等,自动生化分析仪,心电图机,各种监护仪,中央监护系统,多功能磁悬浮电凝器,超声刀,佳乐等离子止血系统,呼吸机,心脏除颤仪,万能电动手术床,自动麻醉机,远红外消毒机,整套胸腹及普外等各专外科手术器械,全套及各种规格的腔内镜诊断和手术系统如：电视腹腔镜,胸腔镜,膀胱镜,输尿管肾镜,胆道镜,胃、十二指肠镜,结肠镜,关节镜,椎间盘镜,喉镜、鼻窦镜;SWISSEMSIV代碎石清石系统,靶点热凝射频介入系统,前列腺汽化电切系统;其它：如宫腔镜、阴道镜等及内镜手术成像系统和相关的设备等。

楚东医院是自1993年以来,以赵长松博士为首的专业团体倾心打造的省级、国家级微创专业品牌。当前开展的多种治疗和相关服务项目为省内、国内首家开展或首创,有些技术曾走出国门并赢得国际同行的赞誉。我院常规开展各类腔、内镜手术,尤其擅长电视腹腔镜手术,做腹部手术如胆、肝、胃肠、脾、胰、肾上腺、肾、输尿管手术以及子宫附件等外科和妇科手术不用开刀剖腹;同时开展消化内镜如电子胃镜、十二指肠镜、胆道镜,经腔内治疗胃肠、胆管疾病如：ERC、ERCP、EST、LCE、LCAS、NBD等,不用开刀;再如泌尿内镜如肾镜、膀胱镜、输尿管镜等,治疗肾、输尿管、膀胱疾病;EMS碎石清石系统通过PCNL几乎能将所有泌尿系统结石粉碎并通过微创不开刀的方法将其清除;以前传统手术做前列腺摘除出血多、要切开腹部,创伤大,恢复慢,并发症、后遗症多,现在用膀胱镜经尿道行前列腺汽化电切术,不开刀,出血少、手术快、恢复迅速、创伤少、痛苦小。体外震波碎石可将肾、输尿管、膀胱结石通过体外震波将其击碎后经小便排出体外,不用开刀,对人体几乎无损伤;靶点热凝射频介入系统可在安全无创的状态下治愈本需开刀治疗的椎间盘突出症等,微创治疗的益处和实例不胜枚举。

楚东医院辛勤地劳动,通过自身的不断努力,培养出一大批专业性很强的技术人员队伍,曾派专业人员赴澳大利亚、日本、德、美、法、意大利、新加坡等发达国家和地区进行专业进修和考察,亲自主持电视腹腔镜(VLS)手术数万例,均获得成功,积累了丰富的VLS手术的临床经验。我院自主研发的“腹腔镜下经胆道镜行胆总管括约肌顺行切开术”技术,荣获江苏省卫生厅2004年医学新技术引进一等奖,这是全省唯一获此殊荣的民营医院、唯一的微创专业的医疗机构。淮安市2004年科技进步二等奖,这是全市唯一获此殊荣的民营医院、唯一的微创医疗机构、盱眙县唯一的同类奖项。2008年3月,江苏省科技情报研究所“200832B2500641”号查新报告证实：楚东医院已历经三年开展的腹腔镜下肝内胆管狭窄伴结石的取石和狭窄切开及腔镜和胆道镜下钬激光碎石治疗肝内胆管和胆总管下端结石嵌顿,是该院院又一项填补国内国际业内领域空白的成熟技术。

楚东医院自主研究、开展了具有国际国内领先水平的手术,如：腹腔镜下胃肠手术;多镜联合治疗肝内外胆管结石;内镜下胃肠道手术;腔镜下肾、输尿管多发性结石取石术;腹腔镜下胆肠吻合术;腔镜下肾及肾上腺肿瘤切除;经胆道镜行肝内胆管狭窄切开并取石;腹腔镜下睾丸精索静脉曲张结扎术;腹腔镜下小儿疝气手术;腹腔镜下子宫肌瘤和附件囊肿手术;腔镜下前列腺肥大摘除术;腹腔镜胆道镜胆管括约肌顺行切开术;新型腹腔镜技术治疗肝内外胆管结石伴狭窄;EMS系统治疗泌尿系结石;靶点热凝介入治疗椎间盘突出症,还有NOTES的前时代手术如单孔腹腔镜手术、经脐阴联合入路手术及单孔保胆手术等。以上手术均在微创内镜下进行,不用开大刀,也是目前本社区能开展这些手术的唯一的医院(各类手术项目见附件)。