重庆儿童康复医院根据自身发展战略，以儿童慢病为主，儿童疑难神经系统疾病综合治疗为重点，形成“一条主线，三大中心”的发展格局，即以“小儿神经系统疾病/儿童脑病”为主线，小儿神经内科、小儿发育行为科、小儿内分泌科等3大中心的发展格局，特色诊疗儿童自闭症、语言发育迟缓、多动症、抽动症、矮小症、性早熟、智力发育迟缓、脑瘫、癫痫、发育迟缓、心理障碍、遗尿症等疑难疾病，为1-18岁儿童青少年提供高品质、精细化的中西医结合诊疗与康复服务。