北京西城治疗甲状舌管囊肿比较好的医院有1、北京大学人民医院，2、北京大学第一医院，3、首都医科大学宣武医院，4、中国医学科学院阜外医院，5、首都医科大学附属北京儿童医院等，甲状舌管囊肿属于内分泌科，北京大学人民医院内分泌科疾病医疗设施齐全，在内分泌科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京大学第一医院内分泌科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京大学人民医院内分泌科
北京大学人民医院以建设医、教、研、管理与国际接轨的大学医院为战略目标，着力建设全国疑难急重症诊疗中心，临床医学教育创新示范基地，临床医学科学研发基地， 医院、医疗卫生体制改革探索、实验、示范基地。现已发展成为集医疗、教学、科研为一体的现代化综合性大学医院。医院正式员工总数2379人，中国工程院院士1名，编制床位1448张(开放床位1700余张)，设有40个临床科室、17个医技科室和25个职能处室。在学科建设方面，医院搭建支持平台、关注重点学科发展，形成了以11个国家教育部重点学科为龙头，以18个卫生部临床重点专科、5个北京大学级研究所、3个北京市重点学科、1个国家中医药管理局中医药重点学科以及国家级人才培养模式示范区、国家级特色专业示范点、国家级教学创新团队为战略支点，临床、教学、科研三大学科集群比肩并行的学科发展布局。
第二名北京大学第一医院内分泌科
北京大学第一医院(北大医院)位于北京老皇城内，是距离中南海最近的医院，是一所融医疗、教学、科研、预防为一体的大型综合性三级甲等医院。拥有着一批国内的首创专业学科以及在我国率先开展的诊疗技术，如国内首创小儿科(1940)、泌尿外科、肾脏病专业、综合医院心血管病房、小儿神经专业等。
第三名首都医科大学宣武医院内分泌科
首都医科大学宣武医院创建于1958年，是一所以神经科学和老年医学的临床与研究为重点，以治疗心脑血管疾患为特色，承担医疗、教育、科研、预防、保健和康复任务的大型三级甲等综合医院。是新中国神经科学的初创基地和培育神经科学人才的摇篮之一,在国内有着重要学术地位。受国家卫生部委托，医院承办全国神经内科医师进修班、神经外科医师进修班、神经放射医师进修班，是国家级继续医学教育培训基地。
第四名中国医学科学院阜外医院内分泌科
中国医学科学院阜外医院（以下简称阜外医院），是国家级三级甲等心血管病专科医院，也是国家心血管病中心、心血管疾病国家重点实验室、国家心血管疾病临床医学研究中心所在地，以诊治各种复杂、疑难和重症心血管疾病而享誉国内外，已成为世界上最大的心血管疾病诊治中心和集医疗、科研、预防和人才培养于一体的国家级医学研究与教育中心。医院设有35个病房，26个手术室（其中包含6个复合技术手术室），17个导管室，1521张编制床位数，实际开放床位数1279张。在职员工3380人，院士6人，国家级、省部级有突出贡献专家21人，享受政府津贴77人，中高级职称专业技术人员1289人（数据截至2019年3月31日）。同时，配备有血管造影机、双源CT、核磁共振、PET-CT等与世界接轨的医疗科研设备。
第五名首都医科大学附属北京儿童医院内分泌科
首都医科大学附属北京儿童医院是集医疗、科研、教学、保健于一体的三级甲等综合性儿科医院，前身是我国现代儿科医学奠基人诸福棠院士于1942年创办的北平私立儿童医院。医院总占地面积7万平方米，建筑面积12万平方米，编制病床970张，年门诊量300余万人次，住院病人7万余人次，手术逾2.3万例。2017年，医院被国家卫生健康委(原国家卫生计生委)批准成为国家儿童医学中心，2019年被批准设立国家儿童肿瘤监测中心，为儿童血液病、恶性肿瘤防控提供大数据支撑。 [收起]