内蒙古治疗肛瘘比较好的三甲医院有1、赤峰市医院，2、乌海市人民医院，3、乌兰察布市中心医院，4、巴彦淖尔市医院，5、内蒙古民族大学附属医院等，肛瘘属于肛肠科，赤峰市医院肛肠科疾病医疗设施齐全，在肛肠科疾病治疗方面有着丰富的经验；乌海市人民医院肛肠科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名赤峰市医院肛肠科
赤峰市医院始建于1951年，是集医疗、教学、科研、康复和预防保健于一体的大型综合性三级甲等医院，被自治区卫生厅确定为心脏死亡捐献器官移植、肾、心脏、肝脏移植试点医院，现有34个临床专业、45个病区、20个医技科室和22个行政职能科室。年门诊量达89万人次，收治住院病人6万余人次。
第二名乌海市人民医院肛肠科
乌海市人民医院成立于1986年，由原乌海市第一人民医院与第二人民医院合并成立，位于乌海市海渤湾区。医院分临床、医技、行政和后勤四部分，心血管内科、骨外科、肾内科、神经内科、普通外科、妇产科是重点专科，胸外、脑外、眼外、血液、内分泌、中西医结合、老年病为特色专业。
第三名乌兰察布市中心医院肛肠科
乌兰察布市中心医院始建于1950年,1995年被卫生部评定为“三级乙等”医院,院内有心胸外科、普外科、泌尿外科、神经内科、康复医学科5个重点学科。其中,心胸外科和康复医学科为自治区重点学科。目前心胸外科正在申报自治区领先学科,所开展的“低体重婴幼儿重症先心病外科治疗”和“神经内科三级康复”技术被自治区作为新技术项目加以推广,特别是心脏外科技术在国内享有盛誉。
第四名巴彦淖尔市医院肛肠科
巴彦淖尔市医院位于内蒙古自治区西部，始建于1958年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的大型三级甲等综合医院，内设临床科室45个，医技科室19个。急诊急救医学、康复医学为内蒙古自治区医疗卫生重点学科，急危重症救治中心、康复医学中心、肿瘤整合医学中心为自治区领先（重点）学科培育学科，泌尿系科（含肾内科、泌尿外科）、消化系科（含消化内科、肝胆外科、胃肠外科、内镜整合医学中心）、妇儿生殖中心（含妇科、产科）、儿童医院（含儿内科、儿外科、新生儿科）、呼吸系科（含呼吸内科、心胸外科）、肿瘤整合医学中心、骨科、血液科为院内重点学科。
第五名内蒙古民族大学附属医院肛肠科
内蒙古民族大学附属医院隶属于内蒙古民族大学，医院蒙医内科为自治区重点学科；蒙医内科学、蒙医传统疗术学、蒙西医结合临床被国务院学位委员会授权硕士学位学科点；蒙医疑难病科被国家中医药管理局指定为名老中(蒙)医学术经验继承工作师带徒培养点；神经外科、内一科为吉林大学中日联谊医院硕士点。 [收起]