江苏南京治疗结节性硬化症比较好的三甲医院有1、东部战区总医院，2、南京医科大学第二附属医院，3、南京市中医院，4、江苏省妇幼保健院，5、中国人民解放军东部战区空军医院（原解放军四五四医院）等，结节性硬化症属于神经内科，东部战区总医院神经内科疾病医疗设施齐全，在神经内科疾病治疗方面有着丰富的经验；南京医科大学第二附属医院神经内科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名东部战区总医院神经内科
东部战区总医院是一所历史悠久、医教研训保协调发展的大型现代化综合三甲医院。医院始建于1929年，是中国人自己创办的第一家国立西医院。
第二名南京医科大学第二附属医院神经内科
南京医科大学第二附属医院，暨江苏省第二红十字医院、南京医科大学第二临床医学院，是江苏省卫生健康委直属的三级甲等综合医院，现有临床科室37个，其中省级临床重点专科15个（含建设单位），分别为消化内科、小儿内科、肾脏内科、妇产科、老年医学科、内分泌科、肿瘤科、泌尿外科、眼科、耳鼻咽喉科、心血管内科、神经内科（建设单位）、普外科（建设单位）、医学影像科（建设单位）、呼吸内科（建设单位）。
第三名南京市中医院神经内科
南京市中医院成立于1956年，是一所中医特色明显、中西医结合、集医疗服务功能和急救能力为一体的三级甲等中医院。设有临床及医技科室38个，其中国家级重点学科：中医肛肠病学，国家级重点专科7个；江苏省重点学科：中医脑病学，江苏省重点专科8个，南京市中医重点专科14个。
第四名江苏省妇幼保健院神经内科
江苏省妇幼保健院（江苏省人民医院妇幼分院、江苏省妇幼卫生保健中心）是我省唯一的省级妇幼保健院，是一所集妇幼医疗、保健、科研、教学、康复及业务指导培训为一体的三级甲等妇幼保健机构，现有床位800张，实际开放病床580张。现有工作人员1065人，其中卫技人员858人，高级职称201人，博士生导师11人、硕士生导师35人。
第五名中国人民解放军东部战区空军医院（原解放军四五四医院）神经内科
东部战区空军医院始建于1951年，是南京首批综合性三级甲等医院，是南京市城镇职工医保、居民医保定点医院，南京市急救站分站，南京市劳动能力鉴定检查定点医院，省、市“三信三优”单位，省新农合省级联网医院，全军第二批宇航员遴选体检定点医院，全军交通医学研究所南京临床基地，安徽医科大学临床医院，第二、第四军医大学、江苏大学医学院、皖南医学院、蚌埠医学院、吉林医药学院教学医院医院率先导入国际先进的质量管理体... [收起]